More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0079 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  75.86 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  57.14 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  47.24 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  44.7 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.52 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  49.38 
 
 		 325 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  45.41 
 
 		 239 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  44.44 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  43.22 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  39.05 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  46.46 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  45.45 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  43.75 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  46.75 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  44.95 
 
 		 266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  40.8 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  47.17 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  42.59 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.19 
 
 		 231 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  43.39 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  45.12 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  40.1 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  40.21 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  42.53 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  44.03 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  37.76 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  38.54 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  41.67 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  44.31 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.5 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.1 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  36.55 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  36.95 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  34.1 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  39.8 
 
 		 202 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  37.89 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  35.51 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  39.18 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  39 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  40 
 
 		 203 aa  122  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  41.82 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  32.66 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  35 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  34.39 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.97 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  35.05 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  34.54 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  30.61 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  30.61 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  35.58 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  38.41 
 
 		 202 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  38.33 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  33.7 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  37.58 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  37.64 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  37.65 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  31.58 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  33.12 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  31.58 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  31.58 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  31.58 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  31.58 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  31.58 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  41.06 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  41.61 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.34 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  32.46 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  37.36 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  39.49 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  33.16 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  32.5 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  31.1 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  30.62 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  34.18 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  34.2 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  35.64 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  34.73 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.25 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  30.14 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  32.66 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  36.81 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  33.73 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.91 
 
 		 194 aa  102  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  29.44 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  32.49 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  33.73 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  33.16 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  30.61 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.76 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0334  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  30.64 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  30.64 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  30.53 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  30.53 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  31.21 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  32.98 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>