More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0665 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 
233 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  53.01 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  49.32 
 
 
238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  39.58 
 
 
267 aa  156  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  38.94 
 
 
251 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  43.14 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  38.83 
 
 
242 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  44.5 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  44.9 
 
 
240 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  42.58 
 
 
209 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  36.02 
 
 
241 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  45.09 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  41.98 
 
 
205 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  39.04 
 
 
215 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  40.74 
 
 
205 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  35.15 
 
 
200 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  35.15 
 
 
200 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  35.15 
 
 
200 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  38.51 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 
256 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  28.43 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  30.43 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  30.99 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  30.35 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  31.95 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  27.81 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  31.95 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  32.09 
 
 
202 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  32.09 
 
 
202 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  29.05 
 
 
208 aa  62  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.9 
 
 
211 aa  61.6  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  27.84 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.94 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  40.43 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  32.8 
 
 
246 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  30.71 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  29.34 
 
 
199 aa  58.9  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.72 
 
 
286 aa  58.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0508  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.83 
 
 
211 aa  58.5  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  25 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  31.47 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  29.59 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  31.61 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  32.53 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.56 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.03 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  25.44 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1854  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0687  DedA family protein, putative  25.51 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00613405  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.75 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  29.88 
 
 
198 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  27.91 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  28.03 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  31.47 
 
 
223 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  27.27 
 
 
207 aa  55.5  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  27.32 
 
 
232 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  31.64 
 
 
216 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  31.01 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  27.67 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  24.71 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  31.76 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  29.77 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.17 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  31.76 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  31.76 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  26.14 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  26.67 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  28.46 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36420  uncharacterized membrane-associated protein  31.01 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  30.13 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.06 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  30.61 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  33.08 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  27.81 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  30.89 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.92 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.14 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6928  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  26.74 
 
 
199 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  24.29 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  28.78 
 
 
202 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  29.19 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  33.06 
 
 
215 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  28.89 
 
 
189 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  28.33 
 
 
224 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  28.89 
 
 
189 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  28.89 
 
 
189 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  28.89 
 
 
189 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  29.38 
 
 
208 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  29.46 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  28.89 
 
 
189 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  30.91 
 
 
262 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  33.59 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0744  SNARE associated Golgi protein  30.34 
 
 
205 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 
223 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  30.64 
 
 
241 aa  52  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  28.34 
 
 
211 aa  51.6  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>