More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2080 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  51.52 
 
 		 202 aa  218  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  44.95 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  45.18 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  43.08 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  42.56 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  40.61 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  40.74 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  44.69 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  39.89 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  41.57 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  39.8 
 
 		 202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  39.89 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  38.34 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.2 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  37.06 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.24 
 
 		 207 aa  135  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  39.55 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  41.82 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  38.71 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  39.43 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  43.21 
 
 		 206 aa  131  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  39.56 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.71 
 
 		 220 aa  127  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  40.85 
 
 		 200 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  40.12 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  37.36 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  38.1 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  36.75 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  36.79 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  37.57 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  41.1 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.51 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  36.98 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  40 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  39.53 
 
 		 325 aa  121  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  35.94 
 
 		 202 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  35.57 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  36.84 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.78 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  35.88 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  35.6 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  37.65 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  33.14 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  37.7 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  36.11 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  36.65 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.75 
 
 		 241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  36.76 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 203 aa  114  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 203 aa  114  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  34.44 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.95 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  40.13 
 
 		 218 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  40.13 
 
 		 218 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  35.05 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  33.68 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  35.29 
 
 		 215 aa  111  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1869  alkaline phosphatase  35.56 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  39.49 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  39.26 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  37.5 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  34.03 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  34.03 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  35.06 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  33.16 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  36.17 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  37.97 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.23 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.09 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  36.51 
 
 		 266 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  35 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  35.43 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01771  DedA family alkaline phosphatase-like protein  41.76 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  35.98 
 
 		 266 aa  104  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  35.43 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  37.2 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  33.53 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  37.58 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  34.5 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  33.86 
 
 		 195 aa  101  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  30.99 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  30.99 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  33.88 
 
 		 197 aa  98.6  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  40.52 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  30.65 
 
 		 203 aa  97.8  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.96 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.36 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  34.03 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  31.41 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  36.53 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  31.22 
 
 		 201 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  30.89 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.07 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  35.54 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  30.89 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0736  alkaline phosphatase  34.48 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>