More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1349 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 
241 aa  478  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  68.16 
 
 
228 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  60.09 
 
 
213 aa  268  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  60 
 
 
205 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  60.29 
 
 
325 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  56.49 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  54.73 
 
 
266 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  53.62 
 
 
216 aa  234  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  48.13 
 
 
215 aa  208  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  48.5 
 
 
225 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  51.52 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  48.15 
 
 
232 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  41.52 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  45.32 
 
 
205 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.76 
 
 
231 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  42.93 
 
 
201 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  44.78 
 
 
224 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  44.88 
 
 
215 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  38.94 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  41.23 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  43.35 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  40 
 
 
224 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  43.94 
 
 
198 aa  158  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  42.46 
 
 
211 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  43.22 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  42.21 
 
 
198 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  47.2 
 
 
228 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  43.65 
 
 
239 aa  149  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  41.9 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  42.65 
 
 
217 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  42.7 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  41.05 
 
 
202 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  43.41 
 
 
205 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  41.71 
 
 
206 aa  138  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  35.71 
 
 
213 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  38.5 
 
 
241 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.02 
 
 
206 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.4 
 
 
202 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  37.7 
 
 
208 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  135  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.38 
 
 
207 aa  132  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  37.97 
 
 
208 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  36.63 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  39.78 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  37.19 
 
 
202 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  33.83 
 
 
202 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  40.31 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  38.14 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  35.41 
 
 
210 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  39.68 
 
 
203 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  36.76 
 
 
208 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  37.7 
 
 
219 aa  124  9e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  36.6 
 
 
199 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.16 
 
 
203 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  33.33 
 
 
202 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  38.25 
 
 
203 aa  122  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  39.31 
 
 
199 aa  121  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  35.32 
 
 
203 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  33.82 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36.17 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  32.61 
 
 
218 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.35 
 
 
201 aa  119  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  40 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  32.52 
 
 
208 aa  118  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  36.14 
 
 
208 aa  118  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  38.61 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 
200 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36.25 
 
 
218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  36.65 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  36.65 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  36.41 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  36.41 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  36.41 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  36.41 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  35.84 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  36.36 
 
 
202 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  35.9 
 
 
200 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  32.67 
 
 
202 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  32.98 
 
 
203 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  34.74 
 
 
197 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  32.98 
 
 
203 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  42.28 
 
 
178 aa  112  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.95 
 
 
205 aa  112  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.99 
 
 
222 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  36.69 
 
 
202 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  35.05 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  32.02 
 
 
197 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  32.02 
 
 
197 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  31.79 
 
 
204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  34.24 
 
 
199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  34.29 
 
 
202 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  35.08 
 
 
200 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  34.54 
 
 
201 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.21 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  32.02 
 
 
200 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  34.87 
 
 
200 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.78 
 
 
218 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  35.78 
 
 
206 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  33.82 
 
 
202 aa  107  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  34.54 
 
 
218 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>