More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0759 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
202 aa  385  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  44.21 
 
 
218 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  44.21 
 
 
218 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  46.53 
 
 
197 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  43.68 
 
 
218 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.44 
 
 
203 aa  157  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  41.29 
 
 
211 aa  154  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  40.41 
 
 
212 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  36.73 
 
 
208 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  37.24 
 
 
208 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  40.61 
 
 
209 aa  148  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  35.03 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  42.39 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  40.1 
 
 
215 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  39.39 
 
 
202 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  34.55 
 
 
205 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.38 
 
 
222 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  34.67 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  42.17 
 
 
211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.24 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.5 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  39.77 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  35.38 
 
 
203 aa  132  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  35.78 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.87 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  35.12 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  36.95 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  39.41 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  34.15 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  35.12 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  37.79 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  35.26 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  36.05 
 
 
201 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  34.9 
 
 
220 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  36.5 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  37.7 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  36.63 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  38.62 
 
 
206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  35.29 
 
 
200 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  35.29 
 
 
200 aa  128  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  35.47 
 
 
201 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  35.29 
 
 
200 aa  128  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.1 
 
 
206 aa  128  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  35.29 
 
 
200 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  34.88 
 
 
218 aa  128  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  34.88 
 
 
201 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  34.88 
 
 
201 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  34.71 
 
 
200 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  34.88 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  34.88 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  37.3 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  32.67 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  33.82 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  35.29 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  37.34 
 
 
200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  34.71 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  34.12 
 
 
200 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  33.72 
 
 
201 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  37.31 
 
 
202 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.43 
 
 
218 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  36.99 
 
 
205 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  37.57 
 
 
213 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  34.52 
 
 
200 aa  124  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  34.55 
 
 
198 aa  124  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  38.56 
 
 
206 aa  124  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  36.71 
 
 
200 aa  124  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  36.82 
 
 
202 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  40.65 
 
 
210 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  34.48 
 
 
205 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  38.46 
 
 
200 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  38.46 
 
 
212 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  32.84 
 
 
203 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  37.87 
 
 
208 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  32.84 
 
 
203 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  33.93 
 
 
197 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  37.41 
 
 
201 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36.65 
 
 
218 aa  121  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  40.61 
 
 
202 aa  121  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  34.91 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  37.95 
 
 
213 aa  118  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  33.33 
 
 
204 aa  117  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  36.45 
 
 
205 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.11 
 
 
203 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  34.15 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  36.04 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  33.85 
 
 
219 aa  116  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.8 
 
 
201 aa  115  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  28.02 
 
 
214 aa  115  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  30.65 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.34 
 
 
202 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  29.79 
 
 
203 aa  111  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  31.84 
 
 
202 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  37.58 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.3 
 
 
194 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  35.41 
 
 
266 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.86 
 
 
241 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>