More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06150 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  100 
 
 
205 aa  409  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  48.51 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  46.19 
 
 
213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  46.5 
 
 
205 aa  177  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  47.19 
 
 
241 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  48.19 
 
 
266 aa  175  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  45.08 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  45.63 
 
 
216 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  48.19 
 
 
266 aa  170  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  42.29 
 
 
215 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  46.39 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  42.79 
 
 
228 aa  165  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  48.24 
 
 
325 aa  163  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  44.17 
 
 
215 aa  161  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.65 
 
 
224 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  40.1 
 
 
209 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  43.82 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  45.96 
 
 
224 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.05 
 
 
231 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  45.32 
 
 
207 aa  151  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  45.25 
 
 
206 aa  150  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  41.84 
 
 
205 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  39.2 
 
 
201 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  42.86 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  43.9 
 
 
205 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  39.42 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  40.44 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  42.27 
 
 
208 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  39.68 
 
 
198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.03 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  36.5 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  43.3 
 
 
217 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  44.51 
 
 
228 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  37.5 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  47.17 
 
 
217 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  41.54 
 
 
239 aa  133  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  37.5 
 
 
208 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  38.31 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  40 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  40.2 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  35.96 
 
 
211 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  39.7 
 
 
202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.46 
 
 
202 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  39 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  34.67 
 
 
195 aa  125  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  39.29 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36.9 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.96 
 
 
220 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  34.48 
 
 
203 aa  123  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  37.64 
 
 
218 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  34.9 
 
 
199 aa  121  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  38.8 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  31.5 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  33.5 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  34.67 
 
 
202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  38.86 
 
 
203 aa  118  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  39.76 
 
 
198 aa  118  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  36.51 
 
 
200 aa  117  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  40.61 
 
 
208 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  34.74 
 
 
213 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  38.18 
 
 
202 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.87 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  35.67 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  33.17 
 
 
212 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  34.38 
 
 
218 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  35.58 
 
 
208 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  34.54 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  36.75 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  30.46 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  34.98 
 
 
206 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  34.21 
 
 
199 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  29.56 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  29.56 
 
 
203 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  29.56 
 
 
203 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  32.52 
 
 
211 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  29.5 
 
 
205 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  31.86 
 
 
200 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  31.37 
 
 
200 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  31.37 
 
 
200 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  31.37 
 
 
200 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  31.37 
 
 
200 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  31.37 
 
 
200 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  31.37 
 
 
200 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.11 
 
 
205 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  33.18 
 
 
215 aa  105  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 
200 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01771  DedA family alkaline phosphatase-like protein  37.44 
 
 
223 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  30.88 
 
 
200 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  36.25 
 
 
210 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  32.99 
 
 
201 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0334  SNARE associated Golgi protein  35.98 
 
 
196 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  32.84 
 
 
218 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  32.47 
 
 
201 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  33.33 
 
 
197 aa  101  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  34.71 
 
 
200 aa  101  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  33.53 
 
 
212 aa  101  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  32.84 
 
 
201 aa  101  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>