More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2075 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  100 
 
 		 204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  85.07 
 
 		 203 aa  354  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  85.07 
 
 		 203 aa  354  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.78 
 
 		 202 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  39.13 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  33.5 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  37.13 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  34.22 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  35.71 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  32.99 
 
 		 202 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  34.8 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  35.29 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  32.34 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  33.66 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  32.31 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  33.17 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  32.82 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  30.3 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  37.58 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  33.73 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  32.5 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  34.95 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  33.15 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  34 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  32.38 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  31.61 
 
 		 199 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  33.33 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  35.22 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  29.9 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  29 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.44 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  38.27 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  34.84 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  32.16 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.65 
 
 		 228 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  29.95 
 
 		 212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  32.11 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.81 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  31.96 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  31.22 
 
 		 228 aa  111  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  31.96 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  28.5 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.64 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  30.96 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  33.95 
 
 		 325 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  30.96 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  29 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  30.05 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  30.96 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  30.96 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  30.46 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.79 
 
 		 241 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  29.44 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  30.46 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  27.86 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  29.8 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  29.95 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  29.95 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  27.14 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  30.15 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.29 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  30.53 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.12 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  31.16 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  32.19 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  29.08 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  33.75 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  30.2 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  32.37 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  29.15 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  32.14 
 
 		 200 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  32.97 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  28.42 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  28.95 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  28.95 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  29.65 
 
 		 266 aa  101  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  32.14 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  29.73 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  32.95 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  29.35 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  32.1 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  29.47 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  27.81 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 239 aa  97.8  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  25.74 
 
 		 202 aa  97.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.26 
 
 		 194 aa  97.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  29.02 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01771  DedA family alkaline phosphatase-like protein  33.85 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  28.29 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  29.15 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  31.71 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.98 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  33.85 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1869  alkaline phosphatase  32.91 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  28.14 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  27.92 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  28.14 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  28.79 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>