161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36420  uncharacterized membrane-associated protein  100 
 
 		 184 aa  345  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  42.37 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  37.87 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  35.93 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  30.16 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  30.26 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  30.26 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  30.26 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  32.26 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  28.07 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  33.12 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  31.11 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  34.59 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  31.11 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  29.73 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  30 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  30 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  30 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  34.78 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  29.41 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  29.65 
 
 		 267 aa  54.7  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  30.52 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  25.81 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  34.85 
 
 		 325 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  34.85 
 
 		 325 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1744  DedA family membrane protein  30.37 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0059834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1475  dedA protein  30.37 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.937039  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  25.86 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  32.82 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.22 
 
 		 458 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  26.32 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  34.62 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  31.95 
 
 		 321 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  28.35 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  26.14 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  31.29 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  32.85 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  25.87 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  25.87 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  25.87 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  24.2 
 
 		 235 aa  48.5  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  25.87 
 
 		 201 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  25.87 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  27.59 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  21.76 
 
 		 217 aa  47.8  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  25.87 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  22.16 
 
 		 229 aa  47.8  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  25.79 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  29.52 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  29.52 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  26.67 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  28.34 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  28.86 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  27.75 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  26 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  23.7 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  24.14 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  29.48 
 
 		 362 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  30.64 
 
 		 342 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  29.31 
 
 		 348 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  27.75 
 
 		 221 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  29.31 
 
 		 348 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  24.44 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.83 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  29.31 
 
 		 341 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  22.96 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  29.31 
 
 		 373 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.33 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  32.06 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1745  DedA family protein  23.97 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0507809  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  27.32 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.94 
 
 		 233 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  29.48 
 
 		 349 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  30.29 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  22.96 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 		 256 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  25.5 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  25.77 
 
 		 277 aa  44.7  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  24.48 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  25.17 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  24.48 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  30 
 
 		 339 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  25.17 
 
 		 218 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  25.17 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  23.44 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  29.45 
 
 		 238 aa  44.7  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 		 331 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  22.94 
 
 		 279 aa  44.7  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.77 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  25.71 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  26.62 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  30.06 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>