262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4673 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  100 
 
 		 339 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  92.83 
 
 		 321 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  77.74 
 
 		 338 aa  517  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  73.02 
 
 		 362 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  70.97 
 
 		 348 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  70.97 
 
 		 348 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  71.55 
 
 		 341 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  70.97 
 
 		 373 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  71.05 
 
 		 342 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  70.47 
 
 		 349 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  69.36 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  69.65 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  69.36 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  69.36 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  70.64 
 
 		 346 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  69.36 
 
 		 381 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  69.36 
 
 		 381 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  41.08 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  38.74 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 		 325 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 		 325 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  39.63 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  38.41 
 
 		 330 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  35.81 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  38.08 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 329 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  35.31 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  33.94 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  35.08 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  35.08 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  35.08 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  34.81 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  33.55 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  34.47 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  34.47 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  34.47 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  34.47 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  34.47 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  34.47 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  34.47 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  33.33 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  35.15 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  31.95 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  32.53 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  34.84 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  34.03 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  32.43 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  30.61 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  31.83 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  33.57 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  31.37 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  29.69 
 
 		 268 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  27.86 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  34.19 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  29.1 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  30.87 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  29.79 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  32.67 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  32.85 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  30.87 
 
 		 201 aa  68.6  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  32.89 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  29.08 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  21.88 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.06 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  22.28 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  22.55 
 
 		 702 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  22.87 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  26.46 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  24.06 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  23.12 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.58 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  22.83 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  22.83 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  26.8 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  22.83 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  25.85 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.85 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  22.34 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  27.97 
 
 		 212 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  31.72 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  22.37 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  26.42 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  25.93 
 
 		 203 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  22.28 
 
 		 204 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  24.67 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  22.37 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  26.92 
 
 		 218 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  22.37 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  29.85 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  27.74 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  22.37 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  26.57 
 
 		 223 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  24.67 
 
 		 203 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>