243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1389 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  611  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  39.54 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  38.57 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  38.57 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  39.13 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  36.88 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  38.31 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  37.99 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  36.81 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  36.03 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  36.93 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  35.45 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  34.39 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  35.45 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  38.23 
 
 		 330 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  34.78 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  37.5 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  37.5 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  32.45 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  32.45 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  37.5 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  37.5 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  37.5 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  39.24 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  36.3 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  35.88 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  33.11 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  32.86 
 
 		 321 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  34.03 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  33.56 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  33.56 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  33.56 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  33.79 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  35.17 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  33.45 
 
 		 362 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  34.49 
 
 		 348 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  34.49 
 
 		 346 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  34.49 
 
 		 362 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  34.49 
 
 		 362 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  34.49 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  34.49 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  34.49 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  35.71 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  31.72 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  37.78 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  35.36 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  29.47 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  27.62 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  27.84 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  29.76 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  28.67 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.15 
 
 		 676 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  28.57 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  31.36 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  26.14 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  26.29 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.21 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  26.29 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  28.66 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  24.73 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  29.19 
 
 		 218 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  35.48 
 
 		 198 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  29.79 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  31.41 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  29.01 
 
 		 202 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  28.75 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  28.31 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  35 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.72 
 
 		 457 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  27.93 
 
 		 222 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  22.75 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  22.75 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  22.75 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  22.75 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  28.07 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  29.45 
 
 		 219 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  29.61 
 
 		 245 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  32.32 
 
 		 218 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  22.22 
 
 		 204 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  23.39 
 
 		 204 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  27.23 
 
 		 206 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  29.03 
 
 		 220 aa  52.8  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  34.02 
 
 		 227 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  22.22 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  27.89 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  36 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  26.98 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  25.44 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  22.22 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  32.28 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  21.99 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>