More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4169 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  613  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  95.18 
 
 
311 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  57.84 
 
 
322 aa  362  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  54.55 
 
 
324 aa  345  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  43.61 
 
 
334 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  43.91 
 
 
331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  43.87 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  40.26 
 
 
330 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  40.26 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  39.16 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  43.18 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  42.76 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  42.76 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  39.74 
 
 
331 aa  212  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  38.98 
 
 
330 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  38.98 
 
 
330 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  38.98 
 
 
330 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  38.91 
 
 
330 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  38.91 
 
 
330 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  38.34 
 
 
331 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  41.39 
 
 
326 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  39.69 
 
 
330 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  39.24 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  39.24 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  39.24 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  39.24 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  39.24 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  39.24 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  39.24 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  35.18 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  41.27 
 
 
330 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  31.92 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  37.38 
 
 
312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  41.67 
 
 
268 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  35.86 
 
 
321 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  33.78 
 
 
339 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  32.64 
 
 
294 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  30.49 
 
 
351 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  36.09 
 
 
309 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  35.57 
 
 
362 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  35.57 
 
 
362 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  35.59 
 
 
346 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  34.92 
 
 
348 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  34.92 
 
 
348 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  34.92 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  35.57 
 
 
381 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  35.57 
 
 
348 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  35.57 
 
 
362 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  35.57 
 
 
381 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  34.92 
 
 
362 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  34.92 
 
 
349 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  34.92 
 
 
342 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  34.58 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  34.59 
 
 
338 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  31.21 
 
 
345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  31.74 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.91 
 
 
457 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  33.91 
 
 
200 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  23.71 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  28.74 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  27.18 
 
 
221 aa  67  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  28.29 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  32.73 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  27.62 
 
 
206 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  27.14 
 
 
204 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  26.28 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  26.92 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  27.14 
 
 
204 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  27.14 
 
 
204 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  28.14 
 
 
192 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  29.67 
 
 
206 aa  63.2  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32 
 
 
458 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  27.13 
 
 
195 aa  62.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.14 
 
 
521 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  26.13 
 
 
208 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  26.04 
 
 
191 aa  62.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  27.27 
 
 
222 aa  62.4  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  26.63 
 
 
204 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  29.47 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  26.13 
 
 
204 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  28.31 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  26.06 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  27.41 
 
 
232 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  28.95 
 
 
219 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  30.12 
 
 
198 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  27.33 
 
 
220 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  27.33 
 
 
221 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  27.03 
 
 
209 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  28.22 
 
 
221 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  25.83 
 
 
217 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  24.62 
 
 
245 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  28.25 
 
 
202 aa  59.7  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
201 aa  59.7  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  27.33 
 
 
203 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  27.33 
 
 
203 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  29.45 
 
 
202 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  28.12 
 
 
220 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 
223 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>