More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3050 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  540  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  40.29 
 
 
326 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  37.69 
 
 
325 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  37.69 
 
 
325 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  39.92 
 
 
330 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  37 
 
 
322 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  34.94 
 
 
334 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
329 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  35.19 
 
 
330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 
312 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  37.83 
 
 
324 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  35.19 
 
 
330 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  38.49 
 
 
311 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  37.44 
 
 
331 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  33.21 
 
 
330 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  30.19 
 
 
334 aa  148  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 
330 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 
330 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  32.71 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  32.71 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  32.71 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  32.71 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  32.71 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  32.71 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  32.71 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  31.06 
 
 
331 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  37.8 
 
 
311 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  32.84 
 
 
325 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  30.92 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  35.56 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  30.53 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  37.78 
 
 
309 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  30.86 
 
 
349 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  30.47 
 
 
342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  30.08 
 
 
362 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  30.47 
 
 
341 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  30.47 
 
 
348 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  30.47 
 
 
348 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  31.05 
 
 
321 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  31.14 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  30.47 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  29.69 
 
 
346 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  29.69 
 
 
348 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  29.69 
 
 
362 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  29.69 
 
 
362 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  29.69 
 
 
362 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  29.69 
 
 
381 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  29.69 
 
 
381 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 
338 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  29.69 
 
 
339 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  28.24 
 
 
351 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  29.21 
 
 
209 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  36.54 
 
 
198 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.09 
 
 
201 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  26.56 
 
 
199 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  30.91 
 
 
345 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.9 
 
 
215 aa  85.5  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0536  alkaline phosphatase  27.69 
 
 
198 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  27.68 
 
 
208 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.48 
 
 
457 aa  82.4  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  31.84 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  29 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  25.98 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  30.11 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  32.24 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  29.5 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  31.28 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  31.28 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  32.34 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0174  alkaline phosphatase  28.72 
 
 
206 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  27.41 
 
 
204 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  29.5 
 
 
218 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  32.34 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  32.34 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  32.34 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  32.34 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  30.35 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0403  dedA family protein  27.92 
 
 
196 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0394  hypothetical protein  27.41 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0390  hypothetical protein  27.41 
 
 
198 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0415  DedA family protein  27.92 
 
 
196 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0461  dedA family protein  27.41 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  28.93 
 
 
217 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0366  SNARE associated Golgi protein  26.49 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0531  dedA family protein  27.41 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  28.77 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  26.26 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4802  transmembrane protein  26.29 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128128  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  29.5 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  30.26 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  28.09 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  28.77 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0395  SNARE associated Golgi protein  26.8 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0530  dedA family protein  26.9 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  26.97 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  26.97 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>