194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6689 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  100 
 
 		 294 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  61.11 
 
 		 334 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  61.4 
 
 		 325 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  51.23 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  51.23 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  51.23 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  51.23 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  51.23 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  51.23 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  51.23 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  49.47 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  50.53 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  49.65 
 
 		 331 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  47.9 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  48.77 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  48.42 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  48.07 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  48.07 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  48.07 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  47.87 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  47.92 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  50.52 
 
 		 328 aa  248  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  35.36 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  35.36 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  34.42 
 
 		 326 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  35.25 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  34.15 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  35.16 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  32.76 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  32.4 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  31.96 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  32.16 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  32.84 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  34.18 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  32.5 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  34.18 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  32.84 
 
 		 373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  33.21 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  31.32 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  31 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  32.96 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  32.86 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  32.14 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  31.79 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  31.05 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  31.79 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  31.07 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  31.79 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  31.79 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  31.07 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  32.96 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  29.62 
 
 		 338 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  31.14 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  31.43 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  27.39 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0402  SNARE associated Golgi protein  23.98 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0174  alkaline phosphatase  23.24 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  28.67 
 
 		 192 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  32.9 
 
 		 206 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  32.22 
 
 		 218 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.69 
 
 		 457 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0530  dedA family protein  24.71 
 
 		 198 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0531  dedA family protein  24.71 
 
 		 198 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  23.31 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  32.48 
 
 		 677 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  26 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.24 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  29.65 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.28 
 
 		 676 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0395  SNARE associated Golgi protein  23.32 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  28.67 
 
 		 203 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  28.67 
 
 		 203 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  27.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0461  dedA family protein  23.56 
 
 		 198 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0403  dedA family protein  23.56 
 
 		 196 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0480  dedA family protein  24.48 
 
 		 197 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0394  hypothetical protein  23.56 
 
 		 198 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0390  hypothetical protein  23.56 
 
 		 198 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  31.15 
 
 		 205 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0415  DedA family protein  23.56 
 
 		 196 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  29.95 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4843  dedA family protein  22.99 
 
 		 197 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  30.25 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.7 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  30.32 
 
 		 203 aa  48.9  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  31.97 
 
 		 218 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.85 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  27.91 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  30.77 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1476  alkaline phosphatase-like protein  22.84 
 
 		 165 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.24 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1745  DedA family protein  22.84 
 
 		 165 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0507809  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  29.2 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.21 
 
 		 207 aa  46.6  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  27.85 
 
 		 221 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  32.5 
 
 		 437 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0536  alkaline phosphatase  24.38 
 
 		 198 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>