222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0949 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  100 
 
 		 321 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  92.83 
 
 		 339 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  76.8 
 
 		 338 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  72.67 
 
 		 362 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  70.5 
 
 		 373 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  70.5 
 
 		 341 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  70.19 
 
 		 348 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  70.19 
 
 		 348 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  70.28 
 
 		 349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  70.28 
 
 		 342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  67.89 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  67.58 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  67.58 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  68.92 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  67.89 
 
 		 381 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  67.89 
 
 		 381 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  67.58 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  41.88 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  40.69 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  40 
 
 		 345 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  39.38 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  39.32 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  39.32 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  37.67 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  36.21 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  37.33 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 329 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  37.15 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  35.12 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  35 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  35 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  35 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  35 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  35 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  35 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  35 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  33.88 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  33.88 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  33.88 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  32.89 
 
 		 331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  32.9 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  32.09 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  33.44 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  34.49 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  31.33 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  34.23 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  33.22 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  29.86 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  33.91 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  32.86 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  33.68 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  30.96 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  31.05 
 
 		 268 aa  95.9  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  33.87 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  30.32 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  26.12 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  31.29 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  27.81 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  24.62 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  32.88 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  22.97 
 
 		 702 aa  59.3  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  22.53 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  25.38 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  23.63 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  26.87 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  24.18 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  28.03 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  24.18 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  27.69 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  25.56 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  24.18 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  29.71 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  27.75 
 
 		 193 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  22.73 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.46 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  25 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  26.72 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  29.77 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  21.05 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  26.67 
 
 		 223 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 189 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  28.46 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  31.5 
 
 		 198 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  26.03 
 
 		 199 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  23.63 
 
 		 204 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  29.77 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  27.82 
 
 		 212 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  26.02 
 
 		 229 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  31.11 
 
 		 200 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  30 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 223 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  25.17 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  29.01 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  29.01 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  22.29 
 
 		 204 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.88 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>