258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6646 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 338 aa  678    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  77.74 
 
 		 339 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  76.8 
 
 		 321 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  72.22 
 
 		 362 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  71.35 
 
 		 341 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  71.35 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  71.35 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  71.68 
 
 		 373 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  71.47 
 
 		 342 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  70.88 
 
 		 349 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  75.8 
 
 		 346 aa  474  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  70.52 
 
 		 362 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  70.81 
 
 		 348 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  70.52 
 
 		 381 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  70.52 
 
 		 381 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  70.52 
 
 		 362 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  70.52 
 
 		 362 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  43.09 
 
 		 351 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  40.65 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  40.72 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  37.34 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  37.34 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  37.42 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  37.13 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  36.81 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  37.29 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  36.45 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  34.62 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  34.12 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  35.2 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  35.2 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  35.2 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  35.2 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  35.2 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  35.2 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  35.2 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  31.73 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  33.33 
 
 		 331 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  34.64 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  34.95 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  31.8 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  35.17 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  32.21 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  32.53 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  31.76 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  30.41 
 
 		 311 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  29.62 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  30.89 
 
 		 268 aa  96.3  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  33.77 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  25.29 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  27.14 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  31.94 
 
 		 199 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  27.89 
 
 		 199 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.62 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  25.27 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  27.21 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  24.39 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.17 
 
 		 215 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  32.34 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  25.87 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  25.37 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  26.24 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  25.37 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  31.5 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  28.68 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  29.41 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  29.55 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  31.34 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  24.88 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.03 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  29.8 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  24.88 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  24.74 
 
 		 193 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  25.19 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  24.14 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  23.81 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  29.85 
 
 		 220 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 		 215 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 202 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  29.63 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  27.33 
 
 		 199 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  31.61 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  25.82 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  27.89 
 
 		 203 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  27.89 
 
 		 203 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  27.21 
 
 		 203 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  29.84 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  28.85 
 
 		 211 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  28.43 
 
 		 228 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  32.41 
 
 		 217 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>