277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3852 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 351 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  56.53 
 
 		 345 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  54.9 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  41.88 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  42.12 
 
 		 348 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  42.12 
 
 		 348 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  42.77 
 
 		 373 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  42.77 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  41.14 
 
 		 349 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  41.14 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  41.88 
 
 		 362 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  40.62 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  43.09 
 
 		 338 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  40.73 
 
 		 381 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  40.73 
 
 		 381 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  40.73 
 
 		 362 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  40.73 
 
 		 348 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  40.73 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  40.73 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  41.08 
 
 		 346 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  36.81 
 
 		 325 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  36.81 
 
 		 325 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  36.81 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  35.1 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  33.03 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  35.55 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  35.55 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  35.55 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  36.81 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  35.1 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  34.77 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  33.97 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  33.86 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  32.9 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  35.88 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  34.12 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  33.55 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  33.77 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  33.77 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  33.77 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  33.77 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  33.77 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  33.77 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  33.77 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  32.89 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  34.39 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  32.66 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  32.16 
 
 		 294 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  28.01 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  30.53 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  30.11 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  28.24 
 
 		 268 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2311  hypothetical protein  28.48 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  24.5 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  25.57 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  25.65 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0441  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.33 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  26.14 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  26.14 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  28.48 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  26.57 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  28.67 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  31.29 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 212 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.73 
 
 		 702 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  27.11 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.57 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  27.54 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  29.5 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  28.47 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.6 
 
 		 676 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  26.92 
 
 		 193 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.33 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  22.97 
 
 		 220 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1082  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.95 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 205 aa  57  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  30.19 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  23.6 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  29.8 
 
 		 189 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  29.8 
 
 		 189 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  29.8 
 
 		 189 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  26.59 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  26.01 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  29.8 
 
 		 189 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  31.74 
 
 		 217 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  28.48 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  29.8 
 
 		 189 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  27.81 
 
 		 172 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  24.44 
 
 		 203 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  27.81 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  26.06 
 
 		 218 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  23.49 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>