More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2359 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  100 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  100 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  100 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  98.94 
 
 		 189 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  74.59 
 
 		 188 aa  287  8e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  80.21 
 
 		 192 aa  278  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  80.21 
 
 		 192 aa  278  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  80.21 
 
 		 192 aa  278  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  80.21 
 
 		 192 aa  278  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  80.21 
 
 		 192 aa  278  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  80.21 
 
 		 192 aa  278  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  79.68 
 
 		 192 aa  277  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  80.21 
 
 		 192 aa  277  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  80.21 
 
 		 192 aa  277  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  56.59 
 
 		 187 aa  210  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  44.02 
 
 		 185 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  41.8 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  41.44 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  36.02 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  38.15 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  33.88 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  38.22 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  37.11 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  35.67 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  35.87 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  37.58 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  38.89 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  36.94 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  37.65 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  40.4 
 
 		 203 aa  104  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  32.45 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  34.76 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  31.91 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  32.42 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  33.33 
 
 		 204 aa  98.6  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  37.58 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  39.84 
 
 		 218 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  37.3 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  37.3 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  29.19 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  30.32 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  29.19 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  32.6 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  28.33 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  27.15 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  29.27 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  29.79 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2694  inner membrane protein YohD  38.93 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  34.27 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  33.14 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  30.94 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  28.99 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  23.24 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  27.33 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  29.22 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  34.87 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  31.93 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  31.93 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  27.41 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  29.87 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  27.39 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  26.42 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  32.48 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  23.73 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  29.17 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  26.75 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  27.38 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  25.42 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  26.11 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  24.58 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  27.27 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  34 
 
 		 672 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  30.53 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  30.53 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  25.73 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  30.53 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 		 206 aa  62  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  32.1 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0366  SNARE associated Golgi protein  26.34 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  29.05 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  37.5 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  28.12 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  23.23 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  26.19 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  29.45 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  26.49 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  27.67 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  25.43 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  23.68 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  28.29 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  22.03 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  28.69 
 
 		 677 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  27.93 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  24.84 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  26.04 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  24.04 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>