More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00824 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  79.88 
 
 		 325 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  79.88 
 
 		 325 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  40.82 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  40.38 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  39.81 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  40.69 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  40.13 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  39.81 
 
 		 330 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  42.37 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  42.38 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  40.13 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  40.13 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  40.13 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  39.75 
 
 		 331 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  39.21 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  38.76 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  38.87 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  38.61 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  38.87 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  39.51 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  38.87 
 
 		 348 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  38.87 
 
 		 348 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  38.76 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  38.98 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  43.52 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  36.81 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  38.62 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  39.33 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  40.13 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  38.49 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  38.49 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  38.49 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  38.49 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  38.49 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  38.49 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  38.29 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  38.29 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  38.29 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  38.29 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  38.29 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  38.29 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  38.29 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  38.96 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  37.42 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  39.68 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  42.35 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  37.46 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  38.1 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  34.59 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  37.62 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  41.94 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  37.37 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  40.73 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  40.88 
 
 		 268 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  34.42 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  34.02 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  28.92 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  25.73 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  25.73 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  25.73 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  25.73 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  25.98 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  25.73 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  35.26 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  25.48 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  25.25 
 
 		 204 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  25.25 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.86 
 
 		 457 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  29.19 
 
 		 206 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  36.13 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  24.85 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  35 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  28.99 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.94 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  30.25 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  32.03 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  32.05 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  27.49 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  27.49 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  34.34 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  32.05 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  28.24 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  23.72 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  28.07 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  30.96 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  27.42 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  30.96 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  28.95 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  27 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.98 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  25.63 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  27.34 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  27.34 
 
 		 212 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  27 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  29.1 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>