More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0874 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1522  hypothetical protein  36.32 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00239621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2351  hypothetical protein  37.5 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1613  DedA  33.01 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1518  DedA  33.01 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  32.67 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  32.67 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  31.25 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  29.41 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  27.41 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  27.08 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  27.95 
 
 		 245 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  25.13 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  29.65 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  35.29 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  34.45 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  30.13 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  30.13 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  28.26 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  30.13 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  29.13 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  26.29 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  26.29 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  26.13 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  25.98 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  25.52 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  25.52 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  25.52 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  28.03 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  27.86 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  27.16 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.16 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.38 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  30.88 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  28.64 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  27.16 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  30.88 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  30.88 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  30.88 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  30.88 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  27.16 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  30.88 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  28.64 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  27.16 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  27.39 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  27.16 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  32.77 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  27.46 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  30.88 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  27.16 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  26.54 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  28.14 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  26.54 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  28.14 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  30.39 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  26.54 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  26.04 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  26.54 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  26.54 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0536  alkaline phosphatase  26.83 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.35 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  28.14 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  28.14 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  30.87 
 
 		 339 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  28.14 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  26.37 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  24.88 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0049  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  25.26 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  30.32 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  25.13 
 
 		 232 aa  62  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0255  DedA protein  29.08 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.746672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  29.34 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  29.79 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  28.87 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  24.86 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4953  alkaline phosphatase like protein  28.21 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.76 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  28.1 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  28.1 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  31.15 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  28.1 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  26.06 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  26.75 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  26.75 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  24.61 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  24.61 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  25.45 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  25.45 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  25.45 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  25.45 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  25.45 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>