More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1613 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1613  DedA  100 
 
 		 224 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1518  DedA  99.55 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2351  hypothetical protein  97.32 
 
 		 224 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1522  hypothetical protein  72.94 
 
 		 226 aa  328  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00239621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  36.36 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  31.28 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0366  SNARE associated Golgi protein  25.82 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0149  hypothetical protein  28.27 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  30.89 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  28.95 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0049  SNARE associated Golgi protein  32.24 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  29.45 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  32.32 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  34.52 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  27.98 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  29.19 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  30.18 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  34.87 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.25 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  34.26 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  30.1 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  28.09 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  28.09 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  28.09 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  28.09 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  28.09 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.56 
 
 		 668 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  32.19 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  30.14 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  29.29 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  29.88 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  29.29 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  29.29 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  29.29 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  29.29 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  29.29 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  29.29 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  27.53 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.53 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  27.53 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  27.53 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  27.53 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  27.53 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  27.53 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  27.53 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  27.53 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  28.09 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  30.17 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  33.16 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  26.24 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  28.09 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  32.31 
 
 		 681 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.38 
 
 		 457 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  28.09 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  28.09 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0174  alkaline phosphatase  23.7 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  27.4 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  30.25 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  28.92 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  28.92 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  28.5 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  28.92 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  25.99 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  24.52 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  29.05 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  25.38 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  31.46 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  28.22 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  25.94 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  27.47 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  30.54 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  29.05 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  27.66 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  28.09 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  28.79 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  30.39 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  28.18 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  24.51 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  31.75 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.76 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  28.28 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  30.57 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.22 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  31.29 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  29.75 
 
 		 695 aa  56.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  31.29 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  32.86 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10410  uncharacterized membrane-associated protein  34.62 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.644792  normal  0.0211911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.38 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  27.53 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  30.37 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  28.16 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  26.01 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>