More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0149 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0149  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  382  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.77 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  30.38 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  28.88 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  24.21 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1613  DedA  28.49 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1518  DedA  28.49 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  27.18 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  28.05 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  28.18 
 
 
203 aa  63.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  31.17 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2351  hypothetical protein  27.93 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  29.53 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  29.28 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  27.47 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  27.63 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  31.82 
 
 
253 aa  62  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  32.33 
 
 
227 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  27.37 
 
 
195 aa  61.6  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 
224 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  29.11 
 
 
219 aa  61.6  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.77 
 
 
521 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  26.42 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  27.43 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  24.34 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  27.84 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.72 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  30.64 
 
 
219 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  30.64 
 
 
219 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  30.64 
 
 
219 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  30.56 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.56 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  28.38 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  30.64 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.59 
 
 
702 aa  58.9  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  30.56 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  30.56 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  30.56 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  30.56 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  30.56 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  25 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 
222 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  28.92 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  28.47 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.14 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  27.13 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  27.89 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  26.35 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  29.23 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  26.58 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  24.74 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  25.77 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  25.58 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  32.56 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  32.56 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  25.95 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  29.92 
 
 
252 aa  55.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  28.25 
 
 
198 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  28.11 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  27.81 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  24.19 
 
 
198 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  29.25 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  29.23 
 
 
219 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  24.42 
 
 
222 aa  55.1  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  25.95 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  29.55 
 
 
220 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  29.55 
 
 
220 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  29.55 
 
 
220 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  54.7  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  24.47 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  26.14 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.49 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  29.7 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  28.03 
 
 
213 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  25.65 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  23.94 
 
 
214 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  31.58 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  28.66 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.45 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  23.94 
 
 
214 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  26.32 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  25.75 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  26.18 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  25.87 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0536  alkaline phosphatase  24.61 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.76 
 
 
248 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  29.77 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.52 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  24.32 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  26.03 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  29.09 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  27.56 
 
 
209 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  26.43 
 
 
223 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  30.08 
 
 
223 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  25.71 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>