More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1952 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1952  DedA family protein  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  44.28 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  42.93 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  39.25 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.39 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  44.91 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  43.13 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  41.67 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  40.48 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  41.33 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  40.59 
 
 		 202 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.39 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  38.03 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  42.21 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  42.21 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  38.14 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  37.31 
 
 		 212 aa  117  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  35.24 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  36.79 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  34.42 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  33.81 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  35.56 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  35.05 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  31.68 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  36.16 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  31.37 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  32.38 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.65 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  32.56 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  32.2 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.8 
 
 		 207 aa  105  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  36.08 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  30.2 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  35.56 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  34.55 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.86 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  33.17 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  34.55 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  32.34 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.9 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  29.76 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  40.4 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  35.88 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  37.09 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  30.61 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  31.9 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  30.93 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.97 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.75 
 
 		 241 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  30.95 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  36.54 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  35.38 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  32.08 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.84 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  32.21 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  31.94 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  31 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  30.54 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  36.73 
 
 		 325 aa  92.8  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  33.16 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  39.58 
 
 		 248 aa  92  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  33.96 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  35.98 
 
 		 239 aa  91.3  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.14 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.76 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  35.06 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  35.06 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  34.32 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  31.96 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  36.31 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  30.15 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  36.73 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  31.68 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  31.68 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  31.68 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  32.24 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  31.43 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  35.75 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  32.28 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  32.28 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  29.95 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  36.73 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  30.69 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  37.41 
 
 		 266 aa  81.6  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  30.69 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  31.75 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  31.4 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  28.57 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  31.19 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  29.47 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  31.4 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  31.4 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  31.19 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  31.4 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  31.4 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  29.47 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  32.1 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>