More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0726 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
213 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  30.57 
 
 
203 aa  88.6  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  26.23 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.71 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  25.76 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  24.19 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  25.73 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  26.26 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  22.12 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.29 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  25.66 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  28.87 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  25.61 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  24.34 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  28.33 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  29.46 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  25.61 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  29.1 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  26.23 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  26.6 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  21.8 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  27.78 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  30.84 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.77 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  27.53 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  29.52 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  29.45 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  24.02 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  23.08 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  20.85 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  27.07 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  21.31 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  23.86 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  23.86 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  23.86 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  23.46 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  24.62 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  23.86 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  25.14 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  29.45 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  25.14 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  26.15 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  23.08 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  23.08 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  23.3 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5402  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.39 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  24.34 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  23.81 
 
 
239 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  23.63 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  26.11 
 
 
213 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  23.08 
 
 
201 aa  61.6  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  24.68 
 
 
211 aa  61.6  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.58 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  24.86 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  25.5 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  22.75 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  23.7 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.37 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  23.41 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  24.44 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  23.93 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  24.62 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  24.44 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  23.08 
 
 
201 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  26.59 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  21.72 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  23.81 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  21.59 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  28.5 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  25.41 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.53 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.54 
 
 
702 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  25 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  22.91 
 
 
200 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  30.36 
 
 
325 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0884  DedA family protein  24.69 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  24.64 
 
 
326 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  25.32 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06156  hypothetical protein  28 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  23.59 
 
 
200 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  24.19 
 
 
206 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  25.3 
 
 
330 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  24.68 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.58 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  27.33 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  28.37 
 
 
331 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  24.84 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  27.03 
 
 
334 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  24.7 
 
 
330 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  23.23 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  22.49 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  27.59 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  25.99 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  21.94 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1100  SNARE associated Golgi protein-related protein  21.05 
 
 
207 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000000402259  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.49 
 
 
194 aa  55.8  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  21.76 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  29.06 
 
 
328 aa  55.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>