267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1854 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1854  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
249 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  27.75 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  32.48 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  31.55 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  36.42 
 
 
212 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  25.93 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  26.7 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  26.04 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  30.07 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  30.77 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  30.77 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.19 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  29.22 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  33.12 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  29.27 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  27.41 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  26.32 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  26.32 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  26.32 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  29.46 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  28.04 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  21.43 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  27.59 
 
 
202 aa  62.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  24.44 
 
 
202 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  30.77 
 
 
192 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  31.68 
 
 
215 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 
205 aa  62  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  29.58 
 
 
204 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  28.19 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  25.63 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  29.58 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  30.32 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  26.45 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  24.62 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  28.87 
 
 
204 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  28.57 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  25.14 
 
 
203 aa  59.7  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  27.17 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  26.24 
 
 
199 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  29.83 
 
 
267 aa  59.3  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.06 
 
 
215 aa  58.9  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.88 
 
 
457 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  25.6 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  28.17 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  26.32 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  23.31 
 
 
203 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  27.45 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  24.5 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  25.82 
 
 
224 aa  56.6  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  24.16 
 
 
237 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  25.77 
 
 
204 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  25.77 
 
 
204 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  25.63 
 
 
221 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  26.28 
 
 
191 aa  55.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  24.75 
 
 
198 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  23.84 
 
 
198 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  21.62 
 
 
218 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  25.77 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  26.18 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  24 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  27.64 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.43 
 
 
664 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  25.77 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  25.77 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  23.9 
 
 
201 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  25.77 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  23.2 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  29.41 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  25.77 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  27.54 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  27.69 
 
 
216 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  27.15 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  32.06 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.8 
 
 
521 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  25.81 
 
 
204 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  32.43 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  26.18 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
202 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  27.81 
 
 
208 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  22.93 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  24.38 
 
 
206 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  23.38 
 
 
209 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  27 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  34.07 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  30.67 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  27.56 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  26.76 
 
 
211 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  30.94 
 
 
205 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  27.95 
 
 
219 aa  52.4  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  26.63 
 
 
196 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  22.29 
 
 
200 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  31.54 
 
 
198 aa  52  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  28.1 
 
 
214 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  28.1 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  28.08 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  28.77 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  27.03 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  23.87 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  25.82 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>