265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0744 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0744  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  79.21 
 
 
205 aa  325  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03240  uncharacterized membrane-associated protein  41 
 
 
201 aa  136  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.479554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  32 
 
 
241 aa  74.7  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  37.91 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  37.91 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  37.91 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  33.11 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  32.52 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  36.67 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  31.58 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  32.64 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  31.96 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  29.67 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  31.36 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  29.61 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  30.77 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  32.69 
 
 
203 aa  62  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  28.85 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.8 
 
 
201 aa  61.6  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  27.06 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  28.18 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  28.29 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  27.41 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  30.57 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  27.41 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  29.25 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.89 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  29.41 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  27.62 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  26.9 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  31.35 
 
 
227 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  26.9 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  26.9 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  27.92 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 
223 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  25.64 
 
 
208 aa  58.2  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  26.11 
 
 
202 aa  58.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  28.8 
 
 
245 aa  58.2  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  26.84 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.84 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  24.49 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  25.39 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  26.84 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  26.84 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  26.84 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.82 
 
 
286 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  26.84 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  30.34 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  27.95 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1100  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.97 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000000402259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.24 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  27.5 
 
 
251 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  27.07 
 
 
219 aa  55.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  26.9 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  31.38 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  33.53 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  27.87 
 
 
221 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  28.49 
 
 
227 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  29.23 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  26.03 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  26.03 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  29.25 
 
 
206 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  27.32 
 
 
221 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  30.58 
 
 
215 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1179  SNARE associated Golgi protein  29.52 
 
 
233 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  26.8 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  28.43 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  26.8 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  33.33 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  31.4 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  30.73 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  28.98 
 
 
256 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  27.23 
 
 
363 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  26.26 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  30.14 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  28.24 
 
 
209 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  34.05 
 
 
240 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 
212 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  27.5 
 
 
242 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 
212 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 
202 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  26.5 
 
 
220 aa  52  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  30.9 
 
 
198 aa  51.2  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  32.85 
 
 
238 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  30.11 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  26.78 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  28.1 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  26.82 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  29.12 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  25.38 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  22.7 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3035  SNARE associated Golgi protein  28.11 
 
 
243 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  30.11 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  30.11 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  29.61 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  30.11 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  31.64 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>