299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1344 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  100 
 
 		 185 aa  362  2e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  99.46 
 
 		 185 aa  360  6e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  96.76 
 
 		 185 aa  352  2e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  68.28 
 
 		 187 aa  255  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  50.81 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  48.11 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  47.57 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  48.11 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  47.03 
 
 		 190 aa  174  5e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  42.95 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  30.54 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  30.23 
 
 		 201 aa  91.3  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  30.3 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  30.3 
 
 		 198 aa  88.2  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  27.84 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  30.3 
 
 		 198 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  29.61 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  27.45 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  27.17 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  26.8 
 
 		 214 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  26.32 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  27.45 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  26.8 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  27.45 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  28.1 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  33.73 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  27.56 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  25.68 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  25.95 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  26.42 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  26.75 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  26.75 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.75 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  26.75 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  26.75 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  26.75 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  26.75 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  26.75 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  26.92 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  26.11 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  27.53 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  27.39 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  27.39 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  27.39 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  27.39 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  26.14 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  26.75 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  28.11 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  26.14 
 
 		 218 aa  62  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  30.38 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  25.85 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  25.86 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  25.86 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  25.86 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  29.19 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  31.58 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.83 
 
 		 438 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  29.23 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  29.23 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  20 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  23.46 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  25.32 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  26.15 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  31.51 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  25 
 
 		 668 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  28.57 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  28.57 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  29.25 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  25.64 
 
 		 681 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  29.77 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  24.84 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  26.36 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  25.64 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  25.64 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  25 
 
 		 437 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1476  alkaline phosphatase-like protein  27.67 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  25 
 
 		 437 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  26.92 
 
 		 438 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  23.12 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  23.75 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  20.31 
 
 		 695 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1745  DedA family protein  27.67 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0507809  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  24.24 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.21 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  22.88 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  26.54 
 
 		 189 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  25.6 
 
 		 227 aa  51.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  24.26 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  27.63 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  27.63 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  27.03 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  26.45 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  25.6 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1057  alkaline phosphatase  27.87 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000034861  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  26.67 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  27.2 
 
 		 253 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  26.77 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  25.76 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>