More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1215 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  68.28 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  68.28 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  67.74 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  44.39 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  48.66 
 
 		 189 aa  184  7e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  46.52 
 
 		 189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  44.92 
 
 		 190 aa  169  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  45.99 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  48.08 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  33.72 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  28.11 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  28.81 
 
 		 198 aa  91.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  28.81 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  29.28 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  28.81 
 
 		 198 aa  89  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  28.99 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  30.43 
 
 		 185 aa  87.8  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  30.56 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  25.56 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  33.97 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  31.11 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  27.22 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  28.9 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  28.28 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  28 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  28.97 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  27.59 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  28.28 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  28 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  28.31 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  34.4 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  34.4 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  28.74 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  23.2 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  26.11 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  29.79 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  26.6 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 668 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  31.47 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  29.25 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  31.45 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  26.99 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18131  DedA family alkaline phosphatase-like protein  31.06 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00672405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  28.57 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.57 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  29.19 
 
 		 681 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  29.34 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  24.04 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  24.04 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  28.28 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  24.04 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  25.28 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  24.04 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  24.16 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  29.84 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.33 
 
 		 438 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  28.87 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.32 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  26.75 
 
 		 682 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  24.43 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  24.43 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  26.75 
 
 		 682 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  24.43 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  29.37 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  26.89 
 
 		 437 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  26.89 
 
 		 437 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  29.29 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.53 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  26.83 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  26.83 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  26.83 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.39 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  26.81 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  25.93 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  26.86 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  26.86 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  30.72 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  26.43 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  27.44 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  25.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  28.46 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27 
 
 		 469 aa  54.7  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  29.01 
 
 		 438 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  26.83 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  29.29 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  26.53 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  27.44 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  25.18 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>