More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0887 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  60.43 
 
 		 189 aa  245  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  56.68 
 
 		 189 aa  230  9e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  52.41 
 
 		 189 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  55.91 
 
 		 190 aa  207  9e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  44.39 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  47.57 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  47.57 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  47.03 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  48.66 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  37.17 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  37.7 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  36.65 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  36.26 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  32.61 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  36.52 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  30.81 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  32.72 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  39.33 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  34.23 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  37.67 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  37.67 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  36.99 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  37.67 
 
 		 214 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  36.99 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  28.19 
 
 		 193 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  35.17 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  35.86 
 
 		 220 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  31.91 
 
 		 212 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  27.84 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  32.56 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  30.5 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  32.56 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  29.44 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  26.74 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  26.88 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.75 
 
 		 668 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  25.68 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  32 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  27.53 
 
 		 681 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  28 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  32.81 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  22.16 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  26.47 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  27.54 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.55 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  25.47 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  25.47 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  25.47 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  27.54 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  26.22 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  26.22 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  24.32 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.32 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  24.32 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  24.32 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  24.32 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  24.32 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  24.32 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  24.32 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  26.22 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  24.84 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  24.84 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  24.84 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  24.84 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  25.74 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  24.84 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  24.84 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  23.65 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.76 
 
 		 676 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  26.32 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  31.43 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  27.44 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  25.25 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  25.25 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  27.11 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  25.13 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  24.75 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  26.83 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  26.83 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  23.95 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  26.22 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  26.51 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  26.51 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  25.9 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  34.52 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  28.75 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  27.27 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  30.6 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  27.21 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  28.26 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  28.41 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>