More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0055 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  100 
 
 		 641 aa  1237    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.4 
 
 		 684 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  32.9 
 
 		 681 aa  241  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  31.62 
 
 		 695 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  30.72 
 
 		 684 aa  239  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.35 
 
 		 668 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.17 
 
 		 676 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.59 
 
 		 662 aa  208  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  29.45 
 
 		 682 aa  205  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  29.45 
 
 		 682 aa  205  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.82 
 
 		 664 aa  203  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.8 
 
 		 671 aa  193  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  31.15 
 
 		 677 aa  189  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  27.26 
 
 		 678 aa  187  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  27.09 
 
 		 678 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  30.56 
 
 		 686 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  30.16 
 
 		 672 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  28.66 
 
 		 672 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  29.02 
 
 		 672 aa  151  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  29.07 
 
 		 672 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.38 
 
 		 664 aa  150  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.49 
 
 		 664 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3923  SNARE associated Golgi protein  28.24 
 
 		 672 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2518  DedA family membrane protein  28.45 
 
 		 672 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  40.83 
 
 		 437 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  41.42 
 
 		 437 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  39.87 
 
 		 239 aa  120  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  35.52 
 
 		 255 aa  119  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.3 
 
 		 469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  36.53 
 
 		 255 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  36.53 
 
 		 255 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  36.53 
 
 		 255 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  36.53 
 
 		 255 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  36.53 
 
 		 255 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  35.42 
 
 		 254 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  36.61 
 
 		 254 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  35.42 
 
 		 254 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  35.42 
 
 		 254 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  35.42 
 
 		 254 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  35.42 
 
 		 254 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  37.13 
 
 		 254 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.9 
 
 		 254 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  37.13 
 
 		 254 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.51 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  35.38 
 
 		 205 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.39 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  35.52 
 
 		 255 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  35.52 
 
 		 255 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  35.52 
 
 		 255 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  37.91 
 
 		 255 aa  112  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  39.41 
 
 		 208 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  33.85 
 
 		 256 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  40.24 
 
 		 176 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  37.25 
 
 		 218 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  34.95 
 
 		 255 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  34.54 
 
 		 211 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  35.36 
 
 		 256 aa  106  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  39.1 
 
 		 220 aa  105  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.81 
 
 		 256 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  38.46 
 
 		 220 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  39.87 
 
 		 174 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  37.42 
 
 		 176 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  36.97 
 
 		 176 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.65 
 
 		 438 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  34.03 
 
 		 438 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  34.32 
 
 		 176 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  39.52 
 
 		 439 aa  98.2  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  34.72 
 
 		 438 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  35.22 
 
 		 176 aa  97.4  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.27 
 
 		 438 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  38.32 
 
 		 438 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  34.59 
 
 		 241 aa  95.1  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  34.3 
 
 		 232 aa  94  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.2 
 
 		 438 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.72 
 
 		 438 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  37.43 
 
 		 220 aa  93.2  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  34.62 
 
 		 176 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  33.33 
 
 		 176 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  31.71 
 
 		 173 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  44.29 
 
 		 176 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  35.22 
 
 		 252 aa  87  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  44.29 
 
 		 176 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  44.29 
 
 		 176 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  38.65 
 
 		 173 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  36.18 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  38.69 
 
 		 173 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  35.03 
 
 		 173 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  32.91 
 
 		 173 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  35.03 
 
 		 173 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  31.79 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  35.37 
 
 		 219 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  35.81 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.16 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  36.51 
 
 		 179 aa  79  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1821  uncharacterized membrane-associated protein  34.13 
 
 		 179 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.274709 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0188  hypothetical protein  34.13 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0587064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0937  hypothetical protein  35.67 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  36.3 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  29.3 
 
 		 201 aa  76.6  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>