More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4688 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  98.4 
 
 		 438 aa  849    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  93.15 
 
 		 438 aa  747    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  97.26 
 
 		 438 aa  776    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 438 aa  858    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  66.44 
 
 		 438 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  67.81 
 
 		 438 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  71.69 
 
 		 438 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  67.44 
 
 		 437 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  67.21 
 
 		 437 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  61.19 
 
 		 438 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  68.04 
 
 		 439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.48 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  29.42 
 
 		 682 aa  167  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  29.27 
 
 		 682 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.81 
 
 		 676 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  26.15 
 
 		 678 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  26.15 
 
 		 678 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.84 
 
 		 668 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.36 
 
 		 664 aa  133  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  25.89 
 
 		 681 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.83 
 
 		 664 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  38.16 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  38.16 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  38.16 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  38.16 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  38.16 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  39.47 
 
 		 254 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.82 
 
 		 254 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  26.84 
 
 		 695 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  39.47 
 
 		 254 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  39.47 
 
 		 254 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  39.47 
 
 		 254 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  39.47 
 
 		 254 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  36.56 
 
 		 255 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  39.47 
 
 		 254 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  39.47 
 
 		 254 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  36.56 
 
 		 255 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  39.47 
 
 		 254 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  36.56 
 
 		 255 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 		 671 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  34.6 
 
 		 255 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  35.94 
 
 		 255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 		 256 aa  110  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  36.53 
 
 		 641 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  35.76 
 
 		 255 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  34.36 
 
 		 232 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.3 
 
 		 256 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.26 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  34.3 
 
 		 256 aa  103  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.76 
 
 		 664 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  33.53 
 
 		 205 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  32.31 
 
 		 211 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  32.45 
 
 		 173 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  25.06 
 
 		 677 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.31 
 
 		 702 aa  89  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  32.1 
 
 		 220 aa  88.2  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  29.63 
 
 		 173 aa  87  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  31.48 
 
 		 220 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  32.48 
 
 		 173 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  32.48 
 
 		 173 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  32.72 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  29.49 
 
 		 176 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  31.72 
 
 		 176 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  31.85 
 
 		 173 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  33.1 
 
 		 176 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  28.4 
 
 		 176 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0937  hypothetical protein  34.5 
 
 		 232 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  31.79 
 
 		 173 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  32.41 
 
 		 173 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  33.73 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  30.72 
 
 		 176 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  24.55 
 
 		 686 aa  78.2  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.49 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1525  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  32.41 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  28.75 
 
 		 672 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  31.77 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  31.77 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  32.45 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 		 200 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  28.4 
 
 		 176 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  32.17 
 
 		 198 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.19 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  26.88 
 
 		 672 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.03 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.33 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.4 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.75 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.4 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2126  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.38 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0807737  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1171  Pap2  29.21 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00573838  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  29.17 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.78 
 
 		 662 aa  73.6  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2434  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.28 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.535844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2342  PAP2 family protein  29.75 
 
 		 213 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 173 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3032  PAP2 family protein  29.75 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>