134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1013 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1013  rhodanese-like protein  100 
 
 		 133 aa  276  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2906  Rhodanese domain protein  45.83 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1375  Rhodanese domain protein  44.17 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000054151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  29.91 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  31.07 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  27.62 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.04 
 
 		 390 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.25 
 
 		 390 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  32.05 
 
 		 328 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 480 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 		 471 aa  53.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.01 
 
 		 395 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 375 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 461 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  25 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  28.85 
 
 		 330 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.66 
 
 		 395 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 325 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  26.13 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 329 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  27.97 
 
 		 334 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  26.21 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 480 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  38.03 
 
 		 334 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  27.18 
 
 		 398 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  34.86 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  25.96 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  25.25 
 
 		 456 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  30.7 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 218 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 		 377 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  27.62 
 
 		 325 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  30.84 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  26.42 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  27.62 
 
 		 325 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  26.42 
 
 		 269 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  32.84 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  32.84 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  25.71 
 
 		 326 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  25.71 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  27.62 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  29.36 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  24.51 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2254  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.42 
 
 		 564 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 221 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  30 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  24.21 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  26.42 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.21 
 
 		 383 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29 
 
 		 379 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  26.67 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  26.42 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 469 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.78 
 
 		 379 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.78 
 
 		 379 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  32.39 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  25.77 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  29.57 
 
 		 320 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  24.21 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  26.73 
 
 		 459 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  26.42 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 459 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 470 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.39 
 
 		 387 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.18 
 
 		 383 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  27.37 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  33.85 
 
 		 331 aa  42  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.57 
 
 		 386 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  30.1 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.57 
 
 		 379 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  26.09 
 
 		 348 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  24.76 
 
 		 123 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  25.47 
 
 		 140 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 330 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  25.47 
 
 		 140 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25 
 
 		 386 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 218 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  26.09 
 
 		 381 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  25.45 
 
 		 135 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  26.09 
 
 		 362 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  25.45 
 
 		 135 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  26.09 
 
 		 381 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  25.45 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  31.18 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  25.45 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  25.45 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  25.45 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  26.09 
 
 		 362 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  25.45 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  25.47 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>