16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1375 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1375  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 122 aa  241  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000054151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2906  Rhodanese domain protein  91.8 
 
 		 122 aa  221  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1013  rhodanese-like protein  44.17 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  35.51 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  29.25 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 		 325 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 		 325 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  32.86 
 
 		 334 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 223 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  33.33 
 
 		 328 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 222 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.84 
 
 		 817 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>