19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2906 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2906  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1375  Rhodanese domain protein  91.8 
 
 		 122 aa  221  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000054151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1013  rhodanese-like protein  45.83 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 218 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  34.25 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  31.07 
 
 		 222 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  30.19 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  34.58 
 
 		 326 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 		 185 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.88 
 
 		 817 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  32.93 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  32.86 
 
 		 334 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.07 
 
 		 817 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>