More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3723 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  226  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  49.09 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  48 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  45.1 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 175 aa  90.5  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  44.12 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  43.14 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  44.12 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  43.56 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  40.2 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  42.72 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  43.3 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  41.58 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  40.21 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  43.56 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  45.05 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  37.38 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  45.05 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  40.59 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  38.94 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  40.59 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  42 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  38.39 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  43.16 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  43.96 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  43.96 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  40.38 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  45.26 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  40.38 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 476 aa  67  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  43.69 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  39.39 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  43 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  32.73 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 		 269 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  29.91 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  29.91 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  41.94 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  37.62 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  37.37 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 480 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  34.86 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.83 
 
 		 393 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  32.38 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30.1 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  31.48 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 252 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  37.86 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  43.59 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.64 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  40.4 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 478 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  29.31 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  45.12 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.38 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  32.32 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  37.97 
 
 		 423 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  31.07 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 480 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  39.18 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  33.66 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  25 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  25 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  39.18 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  32.41 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  32.41 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  30.7 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  39.24 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 224 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  34.31 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  42.22 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>