156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0707 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0707  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 217 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1756  rhodanese domain-containing protein  95.85 
 
 		 217 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0147  rhodanese domain-containing protein  88.94 
 
 		 217 aa  387  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123976  normal  0.0555089 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0021  rhodanese domain-containing protein  69.44 
 
 		 223 aa  308  4e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.45235  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0928  rhodanese domain-containing protein  60 
 
 		 223 aa  269  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3113  tRNA 2-selenouridine synthase  41.12 
 
 		 354 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4991  tRNA 2-selenouridine synthase  37.4 
 
 		 358 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0663375  normal  0.0359024 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0985  tRNA 2-selenouridine synthase  41.82 
 
 		 342 aa  89  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3130  tRNA 2-selenouridine synthase  37.7 
 
 		 358 aa  88.2  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000658834  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1349  tRNA 2-selenouridine synthase  39.09 
 
 		 356 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0948  tRNA 2-selenouridine synthase  37.61 
 
 		 338 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113987  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1887  tRNA 2-selenouridine synthase  32.2 
 
 		 344 aa  86.3  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.739187 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0608  tRNA 2-selenouridine synthase  44.55 
 
 		 332 aa  86.3  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1434  tRNA 2-selenouridine synthase  44.55 
 
 		 332 aa  86.3  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0278  tRNA 2-selenouridine synthase  33.86 
 
 		 344 aa  85.9  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0521  tRNA 2-selenouridine synthase  44.55 
 
 		 334 aa  85.9  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2041  tRNA 2-selenouridine synthase  39.68 
 
 		 356 aa  85.1  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2327  tRNA 2-selenouridine synthase  38.89 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2383  tRNA 2-selenouridine synthase  33.61 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07681  tRNA 2-selenouridine synthase  40 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104212  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4284  rhodanese-like protein  36.13 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3666  tRNA 2-selenouridine synthase  36.75 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3859  tRNA 2-selenouridine synthase  35.71 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3301  tRNA 2-selenouridine synthase  36.11 
 
 		 353 aa  82  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2384  tRNA 2-selenouridine synthase  37.04 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.55321e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0172  tRNA 2-selenouridine synthase  32.81 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0136  tRNA 2-selenouridine synthase  39.2 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2691  tRNA 2-selenouridine synthase  35.19 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.7307300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4183  tRNA 2-selenouridine synthase  32.81 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0043  tRNA 2-selenouridine synthase  36.22 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1933  tRNA 2-selenouridine synthase  39.81 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1525  tRNA 2-selenouridine synthase  34.26 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2244  tRNA 2-selenouridine synthase  33.6 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.590434  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0176  tRNA 2-selenouridine synthase  32.03 
 
 		 368 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3544  tRNA 2-selenouridine synthase  32.03 
 
 		 369 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4081  tRNA 2-selenouridine synthase  32.03 
 
 		 368 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4730  tRNA 2-selenouridine synthase  34.78 
 
 		 375 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.913097  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1569  tRNA 2-selenouridine synthase  34.78 
 
 		 375 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.866156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0928  tRNA 2-selenouridine synthase  39.02 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5476  tRNA 2-selenouridine synthase  36.84 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361534 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1112  tRNA 2-selenouridine synthase  34.78 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1488  tRNA 2-selenouridine synthase  33.91 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1592  tRNA 2-selenouridine synthase  34.78 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0414382  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0523  tRNA 2-selenouridine synthase  35.4 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09341  tRNA 2-selenouridine synthase  35.9 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1645  tRNA 2-selenouridine synthase  33.62 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0227  tRNA 2-selenouridine synthase  30.47 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.254912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1508  tRNA 2-selenouridine synthase  33.04 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1190  tRNA 2-selenouridine synthase  32.41 
 
 		 344 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000287258  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3699  tRNA 2-selenouridine synthase  32.76 
 
 		 366 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.919346 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0142  tRNA 2-selenouridine synthase  30.89 
 
 		 335 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09351  tRNA 2-selenouridine synthase  36.97 
 
 		 346 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2719  tRNA 2-selenouridine synthase  31.82 
 
 		 372 aa  75.1  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422567 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3656  tRNA 2-selenouridine synthase  30.37 
 
 		 371 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167107 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1955  tRNA 2-selenouridine synthase  30.89 
 
 		 336 aa  75.1  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.190021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1926  tRNA 2-selenouridine synthase  35.04 
 
 		 353 aa  75.1  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1198  tRNA 2-selenouridine synthase  31.11 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2803  tRNA 2-selenouridine synthase  30.43 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3480  tRNA 2-selenouridine synthase  30.43 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10081  tRNA 2-selenouridine synthase  36.97 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.741819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2423  tRNA 2-selenouridine synthase  38.98 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1304  tRNA 2-selenouridine synthase  32.52 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3604  tRNA 2-selenouridine synthase  34.86 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0875  tRNA 2-selenouridine synthase  33.9 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07211  tRNA 2-selenouridine synthase  38.74 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.989493  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3290  tRNA 2-selenouridine synthase  32.76 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1272  tRNA 2-selenouridine synthase  34.92 
 
 		 347 aa  72.4  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1161  tRNA 2-selenouridine synthase  35.78 
 
 		 364 aa  72  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.965775  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3349  tRNA 2-selenouridine synthase  34.26 
 
 		 353 aa  72  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.382984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1022  tRNA 2-selenouridine synthase  32 
 
 		 358 aa  72  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.239082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2715  tRNA 2-selenouridine synthase  34.75 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2084  tRNA 2-selenouridine synthase  32.17 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3478  tRNA 2-selenouridine synthase  30.51 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.527623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2556  tRNA 2-selenouridine synthase  31.25 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2386  tRNA 2-selenouridine synthase  31.86 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0195  tRNA 2-selenouridine synthase  30.71 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0794  hypothetical protein  31.82 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1757  tRNA 2-selenouridine synthase  33.91 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0174  tRNA 2-selenouridine synthase  29.92 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0169  tRNA 2-selenouridine synthase  29.92 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0272703 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16371  tRNA 2-selenouridine synthase  34.59 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.218284 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0816  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.400282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0119  tRNA 2-selenouridine synthase  31.2 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0175  tRNA 2-selenouridine synthase  29.92 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6564  tRNA 2-selenouridine synthase  30.36 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0745888  hitchhiker  0.00486619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0189  tRNA 2-selenouridine synthase  28.91 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0697371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1887  tRNA 2-selenouridine synthase  29.63 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227051  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0697  tRNA 2-selenouridine synthase  33.04 
 
 		 366 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1023  tRNA 2-selenouridine synthase  31.53 
 
 		 374 aa  68.9  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3539  tRNA 2-selenouridine synthase  32.11 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0160  tRNA 2-selenouridine synthase  35.78 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.334237  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3032  tRNA 2-selenouridine synthase  32.82 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000366048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_10242  predicted protein  30.09 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.85356  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2396  tRNA 2-selenouridine synthase  32.74 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0562  tRNA 2-selenouridine synthase  31.82 
 
 		 364 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0932  tRNA 2-selenouridine synthase  28.45 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0620  tRNA 2-selenouridine synthase  28.45 
 
 		 359 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0577  tRNA 2-selenouridine synthase  31.82 
 
 		 361 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43270  tRNA 2-selenouridine synthase  32.43 
 
 		 369 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.829954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4342  tRNA 2-selenouridine synthase  31.82 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  hitchhiker  0.00245617 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>