154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3478 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3478  tRNA 2-selenouridine synthase  100 
 
 		 348 aa  706    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.527623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1545  tRNA 2-selenouridine synthase  53.89 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.256667  normal  0.0827797 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3349  tRNA 2-selenouridine synthase  55 
 
 		 353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.382984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3656  tRNA 2-selenouridine synthase  53.78 
 
 		 371 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167107 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3290  tRNA 2-selenouridine synthase  54.35 
 
 		 350 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3604  tRNA 2-selenouridine synthase  53.75 
 
 		 350 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1926  tRNA 2-selenouridine synthase  49.85 
 
 		 353 aa  318  7.999999999999999e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0523  tRNA 2-selenouridine synthase  49.54 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2715  tRNA 2-selenouridine synthase  48 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0620  tRNA 2-selenouridine synthase  50.17 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1508  tRNA 2-selenouridine synthase  49.68 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1488  tRNA 2-selenouridine synthase  49.68 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4730  tRNA 2-selenouridine synthase  47.59 
 
 		 375 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.913097  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0932  tRNA 2-selenouridine synthase  48.7 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0765  tRNA 2-selenouridine synthase  48.7 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0816  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.400282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1569  tRNA 2-selenouridine synthase  47.91 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.866156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1112  tRNA 2-selenouridine synthase  47.59 
 
 		 375 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1592  tRNA 2-selenouridine synthase  47.59 
 
 		 375 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0414382  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2244  tRNA 2-selenouridine synthase  46.71 
 
 		 350 aa  282  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.590434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1645  tRNA 2-selenouridine synthase  46.61 
 
 		 377 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0754  tRNA 2-selenouridine synthase  48.38 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1022  tRNA 2-selenouridine synthase  46.13 
 
 		 358 aa  281  8.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.239082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3699  tRNA 2-selenouridine synthase  46.59 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.919346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6564  tRNA 2-selenouridine synthase  47.94 
 
 		 355 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0745888  hitchhiker  0.00486619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3666  tRNA 2-selenouridine synthase  43.92 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2556  tRNA 2-selenouridine synthase  49.83 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1757  tRNA 2-selenouridine synthase  44.67 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2803  tRNA 2-selenouridine synthase  47.18 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3480  tRNA 2-selenouridine synthase  47.18 
 
 		 373 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3859  tRNA 2-selenouridine synthase  44.01 
 
 		 353 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1349  tRNA 2-selenouridine synthase  44.18 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3032  tRNA 2-selenouridine synthase  43.96 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000366048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2423  tRNA 2-selenouridine synthase  44.48 
 
 		 353 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1887  tRNA 2-selenouridine synthase  41.25 
 
 		 352 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227051  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2084  tRNA 2-selenouridine synthase  42.3 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5476  tRNA 2-selenouridine synthase  40.06 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361534 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2199  2-selenouridine synthase  41.7 
 
 		 281 aa  205  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_10242  predicted protein  37.46 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.85356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0948  tRNA 2-selenouridine synthase  35.67 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3130  tRNA 2-selenouridine synthase  35.81 
 
 		 358 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000658834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2384  tRNA 2-selenouridine synthase  34.84 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.55321e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3539  tRNA 2-selenouridine synthase  37.46 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3113  tRNA 2-selenouridine synthase  33.43 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0142  tRNA 2-selenouridine synthase  35.57 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2386  tRNA 2-selenouridine synthase  38.64 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2327  tRNA 2-selenouridine synthase  31.71 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2691  tRNA 2-selenouridine synthase  34.89 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.7307300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1525  tRNA 2-selenouridine synthase  34.69 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0672649  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2041  tRNA 2-selenouridine synthase  32 
 
 		 356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3301  tRNA 2-selenouridine synthase  36.36 
 
 		 353 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230491  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07681  tRNA 2-selenouridine synthase  32.66 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104212  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_002950  PG1887  tRNA 2-selenouridine synthase  36.42 
 
 		 344 aa  179  4.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.739187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4991  tRNA 2-selenouridine synthase  35.46 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0663375  normal  0.0359024 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0136  tRNA 2-selenouridine synthase  34.07 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1190  tRNA 2-selenouridine synthase  35.53 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000287258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1933  tRNA 2-selenouridine synthase  31.69 
 
 		 375 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2383  tRNA 2-selenouridine synthase  38.26 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1955  tRNA 2-selenouridine synthase  33.23 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.190021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0278  tRNA 2-selenouridine synthase  38.33 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0985  tRNA 2-selenouridine synthase  31.13 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0928  tRNA 2-selenouridine synthase  31.33 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4284  rhodanese-like protein  35.56 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812807 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09341  tRNA 2-selenouridine synthase  29.5 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1304  tRNA 2-selenouridine synthase  31.63 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09351  tRNA 2-selenouridine synthase  29.2 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0608  tRNA 2-selenouridine synthase  30.42 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1272  tRNA 2-selenouridine synthase  34.46 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1198  tRNA 2-selenouridine synthase  32.94 
 
 		 347 aa  149  8e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0521  tRNA 2-selenouridine synthase  30.65 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0875  tRNA 2-selenouridine synthase  28.57 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0043  tRNA 2-selenouridine synthase  30.5 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07211  tRNA 2-selenouridine synthase  32.3 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.989493  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1434  tRNA 2-selenouridine synthase  30 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10081  tRNA 2-selenouridine synthase  28.96 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.741819  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16371  tRNA 2-selenouridine synthase  32.38 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.218284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0794  hypothetical protein  30.37 
 
 		 366 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0189  tRNA 2-selenouridine synthase  32.67 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0697371 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1161  tRNA 2-selenouridine synthase  32.92 
 
 		 364 aa  126  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.965775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0195  tRNA 2-selenouridine synthase  29.85 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0697  tRNA 2-selenouridine synthase  27.93 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0301  tRNA 2-selenouridine synthase  29.36 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0285  tRNA 2-selenouridine synthase  31.37 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0174  tRNA 2-selenouridine synthase  28.4 
 
 		 384 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0169  tRNA 2-selenouridine synthase  28.4 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0272703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0546  tRNA 2-selenouridine synthase  31.86 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0512  tRNA 2-selenouridine synthase  30.11 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0604  tRNA 2-selenouridine synthase  31.86 
 
 		 364 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0160  tRNA 2-selenouridine synthase  30.23 
 
 		 365 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.334237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3119  tRNA 2-selenouridine synthase  32.41 
 
 		 364 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160373 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0577  tRNA 2-selenouridine synthase  32.41 
 
 		 364 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00453  tRNA 2-selenouridine synthase, selenophosphate-dependent  31.86 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3109  tRNA 2-selenouridine synthase  31.86 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0227  tRNA 2-selenouridine synthase  31.23 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.254912  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0175  tRNA 2-selenouridine synthase  28.4 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0577  tRNA 2-selenouridine synthase  32.95 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00458  hypothetical protein  31.86 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0437  tRNA 2-selenouridine synthase  32.41 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102484  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2396  tRNA 2-selenouridine synthase  28.01 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0562  tRNA 2-selenouridine synthase  32.45 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>