104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1752 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 276 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  98.55 
 
 		 276 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  88.04 
 
 		 276 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  85.51 
 
 		 276 aa  474  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  80.8 
 
 		 276 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  73.63 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  73.26 
 
 		 276 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  69.6 
 
 		 276 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  66.79 
 
 		 273 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  65.58 
 
 		 271 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  63.74 
 
 		 272 aa  354  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  65.93 
 
 		 271 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  62.04 
 
 		 277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  61.09 
 
 		 275 aa  326  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  60.45 
 
 		 281 aa  308  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  60.45 
 
 		 281 aa  308  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  59.41 
 
 		 272 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  41.4 
 
 		 297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  53.64 
 
 		 152 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  57.66 
 
 		 205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  57.66 
 
 		 205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  57.66 
 
 		 205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  57.66 
 
 		 205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  57.66 
 
 		 205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  57.66 
 
 		 142 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  57.66 
 
 		 142 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  50.68 
 
 		 152 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  48.43 
 
 		 182 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  49.32 
 
 		 157 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  49.32 
 
 		 157 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  52.45 
 
 		 143 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  49.31 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  49.03 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  51.45 
 
 		 140 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  47.26 
 
 		 150 aa  145  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  145  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  47.4 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.86 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  47.06 
 
 		 155 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  53.12 
 
 		 128 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  44.2 
 
 		 144 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  35.17 
 
 		 146 aa  91.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  34.66 
 
 		 328 aa  86.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  31.98 
 
 		 333 aa  82  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  36.57 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  40.13 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  40.13 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  40.13 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  40.13 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  40.13 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  40.13 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  37.24 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  30.45 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  35.5 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  35.5 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  39.47 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  33.7 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  39.44 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  38.57 
 
 		 141 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  34.48 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  35.46 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  35.62 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  36.81 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  34.21 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  35.62 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  35.4 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  37.24 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  35.62 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  40.44 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  37.82 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  35.42 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  36.69 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  35 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  36.11 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  35.42 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  35.42 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  35.42 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  55.77 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  32.7 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  35.05 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 111 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  30.83 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 		 111 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  34.02 
 
 		 125 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 111 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 106 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 113 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  37.35 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 115 aa  45.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.92 
 
 		 109 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2448  rhodanese-like protein  27.62 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  31.48 
 
 		 711 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 113 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  32.94 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 		 118 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>