120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0299 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  69.12 
 
 		 271 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  68.75 
 
 		 271 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  64.31 
 
 		 272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  64.21 
 
 		 273 aa  349  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  66.04 
 
 		 276 aa  347  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  64.94 
 
 		 276 aa  345  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  64.21 
 
 		 276 aa  342  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  61.09 
 
 		 277 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  60.07 
 
 		 276 aa  314  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  59.78 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  59.63 
 
 		 281 aa  308  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  59.63 
 
 		 281 aa  308  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  59.41 
 
 		 276 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  59.55 
 
 		 276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  58.8 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  57.46 
 
 		 275 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  38.57 
 
 		 297 aa  175  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  53.42 
 
 		 152 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  51.02 
 
 		 152 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  49.66 
 
 		 182 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  48.68 
 
 		 157 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  48.68 
 
 		 157 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  54.81 
 
 		 205 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  54.81 
 
 		 205 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  54.81 
 
 		 205 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  54.81 
 
 		 205 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  54.81 
 
 		 205 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  48.3 
 
 		 157 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  54.81 
 
 		 142 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  54.81 
 
 		 142 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  48.61 
 
 		 150 aa  149  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  48.94 
 
 		 143 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  49.28 
 
 		 140 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  45.03 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  46.48 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  43.33 
 
 		 287 aa  138  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  45.33 
 
 		 156 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  43.36 
 
 		 155 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  50.79 
 
 		 128 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  44.85 
 
 		 144 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  36.17 
 
 		 146 aa  94.7  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  39.1 
 
 		 139 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  34.41 
 
 		 333 aa  85.5  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  41.4 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  41.4 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  41.4 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  41.4 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  41.4 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  41.4 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  40.76 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  34.62 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  38.76 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  40.82 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  35.21 
 
 		 306 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  39.68 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  39.72 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  39.72 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  37.88 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  34.46 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  39.42 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  38.73 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  38.69 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  37.68 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  33.12 
 
 		 363 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  32.41 
 
 		 316 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  37.32 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  38.69 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  31.68 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  28.21 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  40 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  39.31 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  39.31 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  38.14 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  36.73 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  38.76 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  35.59 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  34.17 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  34.17 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  39.29 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  34.17 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  34.17 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  34.17 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  34.17 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  34.17 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 106 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 139 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  38.32 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  30.58 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  29.75 
 
 		 330 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  30.09 
 
 		 141 aa  48.9  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  30.12 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  28.28 
 
 		 102 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 		 330 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  31.71 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  34.31 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  31.91 
 
 		 112 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>