95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3650 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  70.48 
 
 
271 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  69.74 
 
 
276 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  69.37 
 
 
276 aa  377  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  71.59 
 
 
271 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  67.9 
 
 
276 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  65.19 
 
 
272 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  67.16 
 
 
276 aa  363  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  66.79 
 
 
276 aa  362  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  66.42 
 
 
276 aa  361  9e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  65.19 
 
 
277 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  67.43 
 
 
276 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  64.21 
 
 
272 aa  349  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  66.28 
 
 
276 aa  346  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  61.4 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  59.78 
 
 
281 aa  311  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  59.78 
 
 
281 aa  311  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  42.31 
 
 
297 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  56.85 
 
 
152 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  56.46 
 
 
152 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  51.88 
 
 
182 aa  168  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  53.06 
 
 
157 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  52.38 
 
 
157 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  52.38 
 
 
157 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  58.82 
 
 
205 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  58.82 
 
 
205 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  58.82 
 
 
205 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  58.82 
 
 
205 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  58.82 
 
 
205 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  58.82 
 
 
142 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  58.82 
 
 
142 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  53.52 
 
 
143 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  51.72 
 
 
150 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  54.74 
 
 
140 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  47.97 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  47.68 
 
 
156 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  50.69 
 
 
155 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  48.25 
 
 
287 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  45.52 
 
 
285 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  55.91 
 
 
128 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.96 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  42.75 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  35 
 
 
146 aa  89.7  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  33.51 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  33.54 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  39.74 
 
 
325 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  39.74 
 
 
325 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  39.74 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  39.1 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  39.74 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  39.74 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  39.6 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  31.53 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  37.93 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  40 
 
 
141 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  39.01 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  36.31 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  36.31 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  33.73 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  37.41 
 
 
143 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  33.33 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  35.57 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  31.25 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  33.33 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  31.45 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  33.33 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  31.72 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  31.45 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  31.97 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  32.7 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  32.7 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  32.84 
 
 
139 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  32.61 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  32.73 
 
 
323 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  32.76 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  33.33 
 
 
324 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  35.62 
 
 
320 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  58 
 
 
93 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  33.8 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 
106 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  35.77 
 
 
323 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 
185 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  31.96 
 
 
113 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  36.59 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 
98 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  35 
 
 
302 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2676  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 
106 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  27.73 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  35.23 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  31.62 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 
98 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.4 
 
 
109 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  22.43 
 
 
133 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2448  rhodanese-like protein  28.85 
 
 
123 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>