101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4195 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 276 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  81.88 
 
 		 276 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  80.8 
 
 		 276 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  79.34 
 
 		 276 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  78.97 
 
 		 276 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  73.53 
 
 		 276 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  70.22 
 
 		 276 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  70.59 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  66.42 
 
 		 271 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  66.42 
 
 		 273 aa  361  9e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  67.9 
 
 		 271 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  63.53 
 
 		 272 aa  352  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  61.23 
 
 		 277 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  61.45 
 
 		 275 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  60.07 
 
 		 272 aa  314  9e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  59.49 
 
 		 281 aa  312  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  59.49 
 
 		 281 aa  312  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  40.14 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  54.97 
 
 		 152 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  59.85 
 
 		 205 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  59.85 
 
 		 205 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  59.85 
 
 		 205 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  59.85 
 
 		 205 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  59.85 
 
 		 205 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  59.85 
 
 		 142 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  59.85 
 
 		 142 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  49.35 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  49.32 
 
 		 157 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  49.32 
 
 		 157 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  50 
 
 		 152 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  49.32 
 
 		 157 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  47.44 
 
 		 182 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  51.75 
 
 		 143 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  49.68 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  50.72 
 
 		 140 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  46 
 
 		 150 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  47.22 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  48.65 
 
 		 156 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.21 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  46.71 
 
 		 155 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  52.34 
 
 		 128 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  43.48 
 
 		 144 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  34.72 
 
 		 146 aa  90.9  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  28.75 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  33.33 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  31.93 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  39.22 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  39.22 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  39.22 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  39.22 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  39.22 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  39.22 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  38.62 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  39.6 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  39.01 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  34.06 
 
 		 139 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  37.66 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  37.86 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  36.17 
 
 		 316 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  34.55 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  37.01 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  36.73 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  35.17 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  35.57 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  35.8 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  35.8 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  37.68 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  35.19 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  35.51 
 
 		 143 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  28.81 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  32.98 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  40.15 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  35.8 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  33.13 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  37.98 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  34.16 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  34.36 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  34.36 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  34.01 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  48.28 
 
 		 93 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 		 106 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  39.53 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  28.57 
 
 		 113 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  34 
 
 		 125 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  29.81 
 
 		 137 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  35.06 
 
 		 185 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 		 116 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  28.85 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  31.76 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  26.73 
 
 		 139 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  32.38 
 
 		 132 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  28 
 
 		 455 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  30.61 
 
 		 103 aa  43.1  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 98 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1812  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 103 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1847  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 103 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0832695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  29.69 
 
 		 225 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 		 125 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  32.14 
 
 		 551 aa  42.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>