92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2448 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2448  rhodanese-like protein  100 
 
 		 123 aa  247  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2246  rhodanese domain-containing protein  48.08 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00449361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  38.18 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2676  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  42.5 
 
 		 308 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  43.53 
 
 		 302 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  39.53 
 
 		 305 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  36.14 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  35.53 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  34.45 
 
 		 281 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  34.45 
 
 		 281 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.43 
 
 		 386 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1847  rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 		 103 aa  48.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0832695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1812  rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 		 103 aa  48.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 390 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.91 
 
 		 395 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 277 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  36.7 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.93 
 
 		 398 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  36.56 
 
 		 297 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.69 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  26.17 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 276 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 		 276 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 		 480 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  30.93 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  31.73 
 
 		 272 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  27.62 
 
 		 276 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.93 
 
 		 400 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.93 
 
 		 400 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.93 
 
 		 400 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  32.48 
 
 		 330 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33 
 
 		 390 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  30.1 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 257 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.66 
 
 		 392 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  28.85 
 
 		 273 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 192 aa  42  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  28.72 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  33.91 
 
 		 334 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 480 aa  42  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  32.48 
 
 		 330 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.31 
 
 		 393 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 		 460 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 		 271 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  27.45 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 221 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 221 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  31.43 
 
 		 221 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.96 
 
 		 379 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  27.72 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  32.38 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  32.38 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  30.09 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.43 
 
 		 390 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  32.38 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  32.38 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  32.38 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  32.38 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  32.38 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  28.44 
 
 		 329 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  27.18 
 
 		 276 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  29.52 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  30.83 
 
 		 381 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  29.59 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  30.83 
 
 		 381 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  30.83 
 
 		 362 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  30.83 
 
 		 362 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  29.17 
 
 		 711 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  29.84 
 
 		 346 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  30.33 
 
 		 331 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  31.86 
 
 		 330 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 		 330 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 		 330 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  30.83 
 
 		 362 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 		 109 aa  40  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  33.7 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.43 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  30.83 
 
 		 348 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  28.71 
 
 		 102 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>