49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2657 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  41.46 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2676  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  32.65 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  40 
 
 		 302 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2448  rhodanese-like protein  36.14 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2246  rhodanese domain-containing protein  32.91 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00449361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 		 276 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  33.67 
 
 		 272 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 276 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 276 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 222 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 281 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 281 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 		 276 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 		 276 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  34 
 
 		 276 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  32 
 
 		 271 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  37.21 
 
 		 223 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  38.64 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 		 277 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 228 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 378 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 221 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  35.63 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 		 276 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0119  tRNA 2-selenouridine synthase  31.51 
 
 		 366 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.88 
 
 		 471 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  38.27 
 
 		 297 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1757  tRNA 2-selenouridine synthase  35.29 
 
 		 346 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  28.41 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  32.04 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4714  tRNA 2-selenouridine synthase  34.62 
 
 		 368 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0175  tRNA 2-selenouridine synthase  38.3 
 
 		 365 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  30.19 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 334 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0195  tRNA 2-selenouridine synthase  29.17 
 
 		 376 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0172  tRNA 2-selenouridine synthase  36.54 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0160  tRNA 2-selenouridine synthase  35.29 
 
 		 365 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.334237  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 		 141 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>