27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1227 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  421  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  33.54 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  39.26 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  33.13 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  33.13 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  32.72 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  33.13 
 
 
276 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  32.7 
 
 
276 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  31.29 
 
 
276 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  31.29 
 
 
276 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  31.79 
 
 
276 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  33.13 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  33.14 
 
 
281 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  33.14 
 
 
281 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 
103 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  30.12 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  28.48 
 
 
275 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  35.37 
 
 
107 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 
107 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  35.37 
 
 
107 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 
109 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 
107 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  35.37 
 
 
107 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
228 aa  42  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>