84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2805 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  100 
 
 		 363 aa  716    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  60.62 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  42.74 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  32.87 
 
 		 325 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  32.87 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  31.94 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  33.52 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  33.52 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  33.52 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  33.24 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  32.34 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  30.79 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  32.5 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  33.05 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  32.5 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  33.05 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  33.05 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  34.74 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  34.74 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  31.11 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  31.62 
 
 		 324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  30.25 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  30.81 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  28.98 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  31.34 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  38.07 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  37.16 
 
 		 273 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  30.62 
 
 		 323 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  30.64 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  30.46 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  28.65 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  28.29 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 271 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  35.4 
 
 		 143 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 		 271 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 285 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  32.12 
 
 		 146 aa  85.5  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  32.72 
 
 		 141 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  32.1 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  32.7 
 
 		 152 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  31.8 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 		 276 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  31.33 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  31.33 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  31.33 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  31.33 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  31.33 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  36.88 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  31.74 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  31.74 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  32.18 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  35.15 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  31.71 
 
 		 142 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  32.1 
 
 		 142 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  30.82 
 
 		 150 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  30.45 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  30.45 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  31.6 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  29.88 
 
 		 157 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  29.88 
 
 		 157 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  30.19 
 
 		 152 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  33.75 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  29.89 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  33.12 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  29.88 
 
 		 157 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  30.82 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  31.29 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  31.29 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  31.71 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  29.05 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  27.67 
 
 		 140 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  32.45 
 
 		 128 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1926  ChrB domain-containing protein  30.32 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0096  hypothetical protein  27.7 
 
 		 156 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.806408  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1175  ChrB domain protein  30.77 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105237  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0965  ChrB domain-containing protein  28.93 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4139  ChrB domain-containing protein  29.56 
 
 		 192 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  27.89 
 
 		 139 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1534  hypothetical protein  31.43 
 
 		 181 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>