79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1204 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  319  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  78.15 
 
 
182 aa  253  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  75.5 
 
 
157 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  75.5 
 
 
157 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  74.83 
 
 
157 aa  245  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  76.16 
 
 
152 aa  245  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  76.43 
 
 
140 aa  234  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  72.99 
 
 
205 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  72.99 
 
 
205 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  72.99 
 
 
205 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  72.99 
 
 
205 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  72.99 
 
 
205 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  68.53 
 
 
143 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  72.99 
 
 
142 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  72.26 
 
 
142 aa  216  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  66.23 
 
 
156 aa  213  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  65.52 
 
 
155 aa  205  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  62.16 
 
 
297 aa  197  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  71.09 
 
 
128 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  58.22 
 
 
150 aa  189  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  55.7 
 
 
287 aa  185  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  55.56 
 
 
288 aa  184  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  56.55 
 
 
271 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  57.24 
 
 
271 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  56.95 
 
 
276 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  53.02 
 
 
285 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  58.28 
 
 
276 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  53.69 
 
 
285 aa  177  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  56.95 
 
 
276 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  54.97 
 
 
276 aa  174  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  57.93 
 
 
277 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  57.24 
 
 
281 aa  172  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  57.24 
 
 
281 aa  172  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  56.85 
 
 
273 aa  170  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  53.64 
 
 
276 aa  169  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  52.41 
 
 
272 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  53.42 
 
 
272 aa  168  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  53.64 
 
 
276 aa  167  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  54.42 
 
 
275 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  53.42 
 
 
276 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  52.74 
 
 
276 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  52.9 
 
 
144 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  42.34 
 
 
146 aa  123  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  36.3 
 
 
139 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  37.86 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  32.3 
 
 
363 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  35.04 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  36.43 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  32.85 
 
 
328 aa  80.9  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  36.84 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  36.09 
 
 
325 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  32.84 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  29.23 
 
 
316 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  32.84 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  32.84 
 
 
331 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  32.84 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  32.84 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  32.84 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  32.84 
 
 
273 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  32.86 
 
 
273 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  31.47 
 
 
312 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  29.55 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  28.79 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  62.5 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  30.3 
 
 
306 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  34.09 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  33.83 
 
 
335 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  34.09 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  29.01 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  29.85 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  30.3 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  33.33 
 
 
320 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  31.85 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  28.57 
 
 
324 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  30.22 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  30.22 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  29.63 
 
 
324 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  29.29 
 
 
320 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  29.75 
 
 
323 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>