262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4260 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  71.11 
 
 		 549 aa  724    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  62.88 
 
 		 527 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  62.69 
 
 		 527 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  74.58 
 
 		 535 aa  776    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  65.61 
 
 		 528 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  93.85 
 
 		 569 aa  1010    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  69.35 
 
 		 527 aa  720    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  64.62 
 
 		 533 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  73.6 
 
 		 532 aa  761    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  100 
 
 		 568 aa  1131    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  71.11 
 
 		 549 aa  724    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  64.8 
 
 		 533 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  98.15 
 
 		 541 aa  1058    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  93.38 
 
 		 555 aa  994    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  66.92 
 
 		 527 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  92.61 
 
 		 541 aa  980    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 568 aa  1131    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  85.41 
 
 		 569 aa  905    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  68.57 
 
 		 541 aa  705    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  63.77 
 
 		 535 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  57.77 
 
 		 528 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  58.67 
 
 		 525 aa  552  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  51.9 
 
 		 539 aa  445  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  64.36 
 
 		 411 aa  439  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 		 774 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  43.83 
 
 		 739 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  43.41 
 
 		 551 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  43.13 
 
 		 545 aa  352  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  44.62 
 
 		 555 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  41.76 
 
 		 529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  40.73 
 
 		 529 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  42.01 
 
 		 530 aa  322  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  43.48 
 
 		 531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  41.36 
 
 		 931 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  41.23 
 
 		 548 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  41.34 
 
 		 523 aa  319  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  40.31 
 
 		 528 aa  309  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  42.3 
 
 		 538 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  40.39 
 
 		 896 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  36.38 
 
 		 526 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  36.91 
 
 		 521 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  37.43 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  39.17 
 
 		 361 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  30.88 
 
 		 549 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  31.33 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  24.68 
 
 		 247 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  28.63 
 
 		 265 aa  65.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  25 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  27.14 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 		 140 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  27.14 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  22.95 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  24.42 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.74 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  31.97 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.84 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 		 470 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  38.75 
 
 		 127 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  38.75 
 
 		 127 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  38.75 
 
 		 127 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  38.75 
 
 		 127 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  39.74 
 
 		 127 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 127 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  38.75 
 
 		 127 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  41.25 
 
 		 124 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  38.75 
 
 		 127 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  38.61 
 
 		 119 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  38.75 
 
 		 127 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.9 
 
 		 120 aa  55.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  38.75 
 
 		 127 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 		 144 aa  55.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  36.47 
 
 		 116 aa  55.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 135 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  38.75 
 
 		 127 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  24.75 
 
 		 432 aa  54.7  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  40.7 
 
 		 138 aa  55.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  41.25 
 
 		 124 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  22.94 
 
 		 423 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  36.36 
 
 		 113 aa  54.3  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  35.34 
 
 		 361 aa  53.9  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 		 138 aa  54.3  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 140 aa  53.9  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  40.45 
 
 		 126 aa  53.9  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  26.05 
 
 		 480 aa  53.5  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  36.26 
 
 		 151 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 141 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  28.44 
 
 		 123 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 		 124 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.89 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  35.16 
 
 		 141 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 480 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1183  Rhodanese domain protein  26.23 
 
 		 279 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.915724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 126 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  29 
 
 		 124 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0417  Rhodanese domain protein  32.69 
 
 		 166 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 122 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  35.35 
 
 		 553 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>