217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2551 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
380 aa  762    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
361 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  39.04 
 
 
528 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  38.42 
 
 
526 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  39.7 
 
 
527 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  39.58 
 
 
527 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  39.65 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  38.86 
 
 
527 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  38.57 
 
 
535 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  39.78 
 
 
551 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  40 
 
 
533 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  38.79 
 
 
535 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  36.68 
 
 
529 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  39.14 
 
 
527 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  39.83 
 
 
533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 
774 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 
538 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 
528 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 
525 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  39.43 
 
 
530 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  38.83 
 
 
532 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  38.94 
 
 
523 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  38.94 
 
 
555 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 
529 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 
531 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
541 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  36.81 
 
 
568 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  36.81 
 
 
568 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 
545 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 
541 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  39.1 
 
 
549 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  39.1 
 
 
549 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  38.42 
 
 
569 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  37.43 
 
 
528 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  37.91 
 
 
569 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  38.21 
 
 
541 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  36.83 
 
 
539 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 
739 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  36.44 
 
 
931 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  37.93 
 
 
548 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  36.62 
 
 
896 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  36.67 
 
 
555 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 
521 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  30.45 
 
 
549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  22.22 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 
138 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  25.35 
 
 
247 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  27.63 
 
 
454 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 
220 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  40.38 
 
 
139 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  25.44 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  28.32 
 
 
230 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 
139 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 
617 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  24.01 
 
 
423 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 
128 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
135 aa  56.2  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 
480 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 
135 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 
139 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  24.74 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 
141 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  24.77 
 
 
472 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  38.61 
 
 
139 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  28.74 
 
 
135 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  28.74 
 
 
135 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  28.74 
 
 
135 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  28.74 
 
 
135 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  28.74 
 
 
135 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  28.74 
 
 
135 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  28.74 
 
 
135 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  28.74 
 
 
135 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  32.18 
 
 
135 aa  53.1  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  24.88 
 
 
216 aa  53.1  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  35.53 
 
 
133 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
222 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 
142 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 
139 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34.57 
 
 
132 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  31.53 
 
 
346 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 
139 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 
135 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 
144 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 
480 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 
170 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.01 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 
141 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 
221 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 
144 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 
136 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  27.36 
 
 
161 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  36.84 
 
 
116 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  28.97 
 
 
119 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
134 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 
265 aa  50.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 
138 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1205  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 
137 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>