More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4865 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  97.84 
 
 		 139 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  82.61 
 
 		 139 aa  236  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  83.33 
 
 		 139 aa  223  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  83.33 
 
 		 139 aa  223  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  73.85 
 
 		 144 aa  207  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  88.06 
 
 		 141 aa  205  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  84.06 
 
 		 139 aa  204  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  74.05 
 
 		 146 aa  189  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  71.85 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  73.81 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  65.89 
 
 		 166 aa  177  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  79.84 
 
 		 174 aa  174  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  63.91 
 
 		 142 aa  173  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  79.69 
 
 		 155 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  79.69 
 
 		 155 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  79.69 
 
 		 155 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  79.69 
 
 		 155 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  79.69 
 
 		 155 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  78.91 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  59.7 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  62.31 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  59.54 
 
 		 131 aa  157  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  62.79 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  58.09 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  58.27 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  60.47 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  56.93 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  51.54 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  46.28 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  38.26 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  40.87 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  38.05 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  39.09 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  41.09 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 226 aa  67  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  40.16 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  34.48 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  35.09 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  38.89 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 227 aa  57  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 		 380 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.5 
 
 		 393 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  34.48 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.26 
 
 		 247 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  37.23 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 233 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.21 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 		 480 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  34.18 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 228 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  35.92 
 
 		 280 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  29.67 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  32.91 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  31.45 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  46 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  31.45 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  31.45 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.39 
 
 		 386 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 		 319 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>