More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4245 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  276  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  67.88 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  66.42 
 
 		 137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04680  Rhodanese-like protein  66.42 
 
 		 137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.940144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  67.15 
 
 		 137 aa  180  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  64.23 
 
 		 137 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  63.5 
 
 		 137 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  65.93 
 
 		 139 aa  173  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  65.93 
 
 		 139 aa  173  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  61.31 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  60.58 
 
 		 137 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  52.31 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  47.76 
 
 		 138 aa  139  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  46.38 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  46.38 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  37.68 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  37.68 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  38.73 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  42.34 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  38.73 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  38.73 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  38.73 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  38.73 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  38.73 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  38.73 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  38.73 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  38.73 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  35.07 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  35.07 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  38.03 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  40.15 
 
 		 144 aa  93.2  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  37.32 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  37.32 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  37.32 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  40.15 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  38.85 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  38.85 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  38.85 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  37.68 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  38.85 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  38.85 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  38.85 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  36.5 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  35.82 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  36.23 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  34.56 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  34.56 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  34.56 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  34.56 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  36.23 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  33.59 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  33.82 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  36.23 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  36.5 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  33.82 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  40.74 
 
 		 248 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  35.07 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  32.35 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  32.12 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  31.39 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0809  rhodanese domain-containing protein  33.6 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.321585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  29.79 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  33.09 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  37.14 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  33.09 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  37.76 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  38.41 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  28.47 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  37.68 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  31.85 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  32.09 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.51 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  30.88 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  36.15 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  37.68 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  37.68 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  34.59 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.5 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.5 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  30.15 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  30.15 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  30.15 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  30.15 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  30.15 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  30.15 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  30.94 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  30.15 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>