More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3452 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  100 
 
 		 139 aa  283  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  283  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  92.03 
 
 		 139 aa  263  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  95.68 
 
 		 139 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  73.64 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  84.06 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  83.33 
 
 		 139 aa  203  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  83.33 
 
 		 139 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  70.23 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  71.21 
 
 		 169 aa  183  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  66.67 
 
 		 166 aa  177  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  80.47 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  80.47 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  80.47 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  80.47 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  80.47 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  78.29 
 
 		 174 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  79.69 
 
 		 155 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  68.25 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  63.28 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  63.78 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  57.35 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  57.35 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  58.14 
 
 		 136 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  60.31 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  55.73 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  57.36 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  57.35 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  48.84 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  42.98 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  37.39 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  33.91 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  37.27 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  70.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  39.84 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 227 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  37.72 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  34.83 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  31.25 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  31.25 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 224 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.74 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  33.71 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  36.05 
 
 		 480 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.17 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  34.83 
 
 		 247 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  40 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 235 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  37.08 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 235 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 235 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 		 480 aa  52  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 228 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  36.9 
 
 		 223 aa  52  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  32.91 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 221 aa  50.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  29.69 
 
 		 226 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 		 221 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 257 aa  50.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 277 aa  50.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 220 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  32.91 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30.17 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  36.62 
 
 		 463 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>